Avaliação comparativa de distintos métodos fenotípicos para a detecção de cepas produtoras de carbapenemases
| dc.contributor.advisor | Gales, Ana Cristina [UNIFESP] | pt_BR |
| dc.contributor.advisorLattes | http://lattes.cnpq.br/8402272715765172 | pt_BR |
| dc.contributor.author | Moura, Jhonatha Rodrigo Cordeiro de [UNIFESP] | |
| dc.contributor.authorLattes | http://lattes.cnpq.br/2346858488495749 | pt_BR |
| dc.contributor.institution | Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) | pt_BR |
| dc.coverage.spatial | São Paulo | pt_BR |
| dc.date.accessioned | 2018-07-27T15:50:10Z | |
| dc.date.available | 2018-07-27T15:50:10Z | |
| dc.date.issued | 2016-08-22 | |
| dc.description.abstract | During the last decade, it has been observed the rapid development of antimicrobial resistance among clinical isolates of Enterobacteriaceae, Pseudomonas spp., and Acinetobacter spp. worldwide. The production of ?-lactamases is the most important mechanism of resistance in Gram-negative bacilli, being the carbapenemases the most versatile mechanisms of carbapenem resistance. These enzymes have broad spectrum of activity, making difficult the selection of adequate antimicrobial therapy. Furthermore, genes encoding ?-lactamases are highly transmissible. Objective: This study aimed to evaluate the performance of five phenotypic methods for detection of carbapenemase-producing Gram-negative bacilli. Methods: Strains previously characterized were pulled out from the LEMC/ALERTA bank of microorganisms. The confirmation of carbapenemase production was performed by ertapenem hydrolysis using MALDI-TOF MS. The phenotypic tests evaluated were: Hodge modified test, ANVISA Technical Note 01/2013, Carba NP and its modification, CarbAcineto NP, Blue-Carba, CarbapenemBac, and CarbapenemBac Metallo. Results: Although the specificity rates of the ANVISA Technical Note and MHT were 100%, the Technical Note (97.3%) showed higher sensitivity rate than that of the MHT (88.5%) for carbapenemase detection. The Carba NP, Blue-Carba and CarbapenemBac tests showed high sensitivity and specificity rates (100%) when colonies subcultured on Mueller-Hinton agar were tested. The sensitivity and specificity rates of Carba NP (98.6 and 100%), BlueCarba (97.1 and 91%) and CarbapenemBac (96.5 and 100%) were slightly lower when bacterial colonies were obtained from blood agar. On the other hand, the sensitivity rates of Carba NP (71.1%) and Blue-carba (68.9%) were unacceptable when colonies obtained from MacConkey agar were evaluated. However, the sensitivity of CarbapenemBac (97.3% sensitivity) was less affected by the MacConkey agar. Conclusions: We conclude that 1. The colorimetric methods showed excellent sensitivity and specificity for carbapenemases detection when bacterial colonies were subcultured on Mueller-Hinton agar or blood agar; 2. Bacteria colonies subcultured on MacConkey agar must not be utilized for colorimetric tests, except for CarbapenemBac, which showed a good sensitivity and specificity rates for detection of carbapenemases independently of the culture medium used to subculture the bacterial isolate. | en |
| dc.description.abstract | Ao longo da ultima década, tem sido observada uma rápida evolução da resistência aos antimicrobianos entre isolados clínicos de Enterobacteriaceae, Pseudomonas spp., e Acinetobacter spp., em todo mundo. A produção de ?-lactamases é o mecanismo de resistência mais importante em bacilos gram-negativos, sendo as carbapenemases a família mais versátil destas enzimas. Estas enzimas possuem amplo espectro de atividade o que dificulta a seleção da terapia antimicrobiana. Além disto, os genes que as codificam, de modo geral, são altamente transmissíveis. Objetivo: Esse trabalho teve como objetivo avaliar comparativamente cinco metodologias fenotípicas para a detecção de carbapenemases em bacilos gram-negativos. Métodos: Foram selecionadas amostras controles da coleção de micro-organismos do LEMC/Alerta. A confirmação da produção ou não de carbapenemases foi realizada pela hidrólise do ertapenem no MALDI-TOF MS. Os testes fenotípicos avaliados foram: o teste de Hodge modificado, a Nota Técnica 01/2013 da ANVISA, o Carba NP e a sua adaptação, CarbAcineto NP, o Blue-Carba, o CarbapenemBac e o CarbapenemBac Metalo. Resultados: Embora a especificidade para o MHT e a Nota Técnica tenha sido 100%, a Nota Técnica (97,3%) foi mais sensível na detecção de carbapenemases que o MHT (88,5%). Os testes Carba NP, Blue-Carba e CarbapenemBac apresentaram sensibilidade e especificidade de 100%, quando colônias subcultivadas em ágar Müeller-Hinton foram testadas. A sensibilidade e a especificidade do Carba NP (98,6 e 100%), do Blue-Carba (97,1 e 91%) e do CarbapenemBac (100 e 96,5%) foram discretamente inferiores quando as colônias bacterianas foram obtidas do ágar sangue. Por outro lado, a sensibilidade do Carba NP (71,1%) e do Blue-Carba (68,9%) foram inaceitáveis quando as colônias foram obtidas do ágar MacConkey. Já a sensibilidade do CarbapenemBac (97,3%) foi menos afetada nesta situação. Conclusão: Podemos concluir que: 1. Os métodos colorimétricos apresentaram excelente sensibilidade e especificidade para detecção de carbapenemases, quando as colônias bacterianas foram subcultivadas em ágar Müeller-Hinton ou ágar sangue; 2. Colônias subcultivadas em ágar MacConkey não devem ser utilizadas para realização de testes colorimétricos, com exceção do CarbapenemBac que apresentou boa sensibilidade e especificidade para a detecção de carbapenemases independente do meio de cultura utilizado para subcultivo do isolado a ser testado. | pt_BR |
| dc.description.source | Dados abertos - Sucupira - Teses e dissertações (2013 a 2016) | |
| dc.format.extent | 130 f. | |
| dc.identifier | https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=3748968 | pt_BR |
| dc.identifier.citation | MOURA, Jhonatha Rodrigo Cordeiro de. Avaliação comparativa de distintos métodos fenotípicos para a detecção de cepas produtoras de carbapenemases. 2016. 130 f. Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, 2016. | |
| dc.identifier.file | 2016-0471.pdf | |
| dc.identifier.uri | http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/46397 | |
| dc.language.iso | por | |
| dc.publisher | Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) | |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
| dc.subject | Carbapenens | en |
| dc.subject | Oxacilinases | en |
| dc.subject | Bacilos gram-negativos | en |
| dc.subject | Ágar macconkey | en |
| dc.subject | Blue-carba | en |
| dc.subject | Carba np | en |
| dc.subject | Carbapenens | pt_BR |
| dc.subject | Oxacilinases | pt_BR |
| dc.subject | Bacilos gram-negativos | pt_BR |
| dc.subject | Ágar macconkey | pt_BR |
| dc.subject | Blue-carba | pt_BR |
| dc.subject | Carba np | pt_BR |
| dc.title | Avaliação comparativa de distintos métodos fenotípicos para a detecção de cepas produtoras de carbapenemases | pt_BR |
| dc.title.alternative | Comparative study of distinct methodologies for carbapenemases detection | en |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/masterThesis | |
| unifesp.campus | São Paulo, Escola Paulista de Medicina (EPM) | pt_BR |
| unifesp.graduateProgram | Infectologia | pt_BR |
| unifesp.knowledgeArea | Ciências da saúde | pt_BR |
| unifesp.researchArea | Medicina | pt_BR |
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