Caracterização molecular do genoma completo do Vírus da Hepatite Delta.
Data
2013
Autores
Cicero, Maira Ferreira 
Orientadores
Komninakis, Shirley Vasconcelos
Tipo
Dissertação de mestrado
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Resumo
Introdução: A Hepatite Delta e uma doenca negligenciada, apesar de poder causar a hepatite fulminante, que por sua vez pode evoluir para a insufiCiência hepatica e morte em 80% dos pacientes. No Brasil, este virus e encontrado frequentemente na regiao Amazonica. O Virus da Hepatite Delta e o unico agente subviral humano que tem estado de dependencia com outro virus, pois para que o seu ciclo se complete ele precisa receber a protecao externa fornecida pelo envelope do Virus da Hepatite B. O unico tratamento disponivel e feito com o Interferon Alfa peguilado, porem com resultados limitados e intensos efeitos colaterais. O uso do papel filtro confere vantagens, pois esse procedimento e menos invasido para o paciente, requer um treinamento minino do coletor, alem de permitir que o transporte das amostras seja feito em envelopes pelo correio. Objetivo: caracterizar a epidemiologia da infeccao na regiao Amazonica do Brasil e pesquisar a presenca de particulas virais recombinantes entre os diferentes subtipos do HDV presentes na regiao. Metodologia: As amostras foram aplicadas e transportadas em papel filtro, seu processamento foi feito fazendo a purificacao do RNA, seguida pela amplificacao por PCR do genoma completo do virus, sequenciamento e construcao da arvore filogenetica. Resultados: Foram analisadas 48 amostras, o tamanho do genoma variou de 1671 ate 1680 nucleotideos. Foi encontrada a delecao de 45 aminoacidos na regiao codificadora do HDAg em uma amostra. Os dominios do HDAg mais conservados foram os do sinal de empacotamento viral, o de ligacao com o RNA e a ribozima. A sequencia coiled-coil, o sinal de localizacao nuclear e regiao nao codificante foram os dominios mais divergentes. A partir da analise da arvore filogenetica todas as amostras foram classificadas como genotipo 3, sem a presenca de recombinacao inter-genotipica, houve a presenca de clusters que caracterizam a origem das amostras, ambos com bootstrap de 100%, o que pode indicar que houve um efeito fundador nesses dois locais. Consideracoes finais: Este e o primeiro estudo com o HDV, ate o presente momento, onde as amostras foram aplicadas e transportadas em papel filtro, alem de ser o trabalho com o maior numero de genomas completos sequenciados e analisados. Na regiao estudada ha uma quantidade significativa de tribos indigenas, o que caracteriza o HDV-3 como genotipo circulante; alem de que neste local ocorre o isolamento geografico entre as populacoes, o que dificulta a Introdução de diferentes genotipos do VHD, diminuindo dessa forma a probabilidade da ocorrencia de recombinacao. Esses dados confirmam os resultados do trabalho que classificou todas as amostras como genotipo 3, sem haver a presenca de recombinacao entre subtipos do HDV na populacao da regiao estudada
Descrição
Citação
São Paulo: [s.n.], 2013. 82 p.