Biotecnologia
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- ItemDesenho racional de inibidores da protease principal do SARS-CoV-2(Universidade Federal de São Paulo, 2023-12-12) Montilla, Rafael Augusto Girao [UNIFESP]; Wurtele, Martin Alejandro [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/0625673643875019; http://lattes.cnpq.br/9507082785734180Este estudo utiliza o software Gnina para realizar o docking molecular para investigar as interações moleculares de novos compostos sintetizados através da reação de Ugi. O foco está no desenvolvimento de inibidores não covalentes direcionados à Protease Principal (Mpro) do SARS-CoV-2. Os resultados de docking são empregados para calcular energias livres de ligação, e esses valores são correlacionados com a concentração inibitória (IC50). Para estabelecer esta correlação, simulações de dockings virtual são conduzidas para compostos conhecidos da literatura com valores medidos de IC50 contra SARS-CoV-2 Mpro. Todos os compostos avaliados, pertencentes à mesma classe de inibidores, são caracterizados como pseudopeptídeos não covalentes. A análise dos dockins revela insights sobre os aspectos estruturais da inibição do Mpro, enfatizando os bolsões S1, S2, S3 e S4 no sítio ativo. O estudo identifica dois leads potenciais; ambos os compostos exibem um modo de ligação invertido em comparação com os peptídeos clivados por Mpro. A abordagem de bioinformática estrutural aqui empregada fornece informações valiosas para o projeto de novos inibidores não covalentes contra SARS-CoV-2 Mpro. É necessária validação adicional através de testes in vitro para confirmar o potencial inibitório dos compostos concebidos. Este estudo contribui para a nossa compreensão das interações moleculares envolvidas na inibição do SARS-CoV-2 Mpro e estabelece as bases para o desenvolvimento de terapêutica antiviral eficaz.
- ItemAvaliação da Moringa oleifera Lam como Agente Coagulante/Floculante no Tratamento de Água para Abastecimento Humano e Desenvolvimento de Protótipo de Baixo Custo para Teste de Floculação(Universidade Federal de São Paulo, 2023-11-30) Munakata, Atilio Akihiro [UNIFESP]; Maass, Danielle [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/3431482044015696; https://wwws.cnpq.br/cvlattesweb/PKG_MENU.menu?f_cod=6A1B99DE7569BAE17AE6591D5924C3AF#O coagulante químico mais utilizado em Estações de Tratamento de Água (ETAs) é o sulfato de alumínio, e seu subproduto pode gerar impactos negativos aomeio ambiente se descartados em locais inapropriado, além de estar associado a doenças como Alzheimer. Inúmeros estudos indicam que os subprodutos provenientes da Moringa oleífera (MO) oferecem diversos benefícios tanto para a saúde humana como para outros diversos assuntos, incluindo as áreas bioquímica, alimentícia e de biocombustíveis. O processo de coagulação e floculação com a MO deve à presença de uma proteína catiônica de alto peso molecular, que desestabiliza as partículas na água e promove a formação de flocos. Isso resulta em redução significativa do número de partículas em suspensão e na quantidade de microrganismos. O objetivo deste estudo foi explorar uma abordagem inovadora para o tratamento de água, empregando a sementede Moringa oleífera como um coagulante natural. Para viabilizar o uso das sementes como coagulante, foi preparada uma solução contendo terra vegetal de forma a simular água bruta, a qual foi empregada como meio de tratamento. Desse modo, foi avaliado a semente de MO para o processo de coagulação em que os experimentos foram conduzidos em Jar-Test contendo um volume total de meio reacional de 1,6 L composto por concentrações de 0.3, 0.5 e 125 mg/L de semente de MO pulverizadas. Ainda, verificou-se a influência dos tempos de agitação (mistura rápida - em 100 rpm) de 10, 15 e 20 min. A taxa de remoção foi determinada por meio de análise de espectrometria de absorção atômica, onde se verificou que a maior eficiência de remoção dos sólidos suspensos (89,1%) ocorreu na seguinte condição experimental: 50 mg/L do coagulante; 5 min de tempo de mistura rápida (100 rpm); 5 min de tempo de mistura lenta (50 rpm); e 120 min de tempo de decantação. Também foi feita uma análise de pH em todas as amostras para verificar se houveram alterações significativas ao utilizar o coagulante. Dessa forma, por meio deste trabalho foi possível determinar que a MO pode desempenhar um papel crucial no tratamento de água, apresentando-se como uma alternativa sustentável, viável e de fácil acesso.
- ItemCaracterização e modelagem in silico de genes e proteínas envolvidas no ciclo do glioxilato do Paracoccidioides brasiliensis(Universidade Federal de São Paulo, 2023-12-11) Moreira, Larissa Slivka [UNIFESP]; Campos, Cláudia Barbosa Ladeira de [UNIFESP]; Capelo, Luciane Portas [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/8886962185715422; http://lattes.cnpq.br/8867737169235839; http://lattes.cnpq.br/5322620389090856A paracoccidioidomicose é uma micose sistêmica causada por fungos do gênero Paracoccidioides spp. endêmica em países da América Latina como Brasil, Argentina, Colômbia e Venezuela. É uma das principais micoses endêmicas da região e representa um problema significativo de saúde pública, especialmente no Brasil, onde há o maior número de casos registrados. O Paracoccidioides brasiliensis, assim como todas as espécies responsáveis pela PCM, é fungo termo-sensível que apresenta duas formas de crescimento distintas conforme a temperatura em que se encontra, sendo a forma micelial filamentosa em temperaturas menores (Tº ambiente ~24ºC) e a forma leveduriforme unicelular em temperaturas maiores (37ºC), sendo a última, a que promove um ambiente favorável para uma relação parasitária do fungo com o hospedeiro, e por consequência o desenvolvimento da PCM. Assim como para outras doenças fúngicas, o tratamento da PCM requer o uso de drogas antifúngicas que, além de poderem conferir resistência, também apresentam conhecidos efeitos hepatotóxicos. Os efeitos colaterais/tóxicos observados são principalmente consequência do fato de que fungos são organismos eucarióticos assim como o hospedeiro humano e, por isso, compartilham semelhanças de suas proteínas, o que dificulta a utilização de drogas mais seletivas para o fungo. Com este problema em mente, este trabalho visou a caracterização in silico dos genes e proteínas associadas ao Ciclo do Glioxilato, um ciclo exclusivo de fungos, plantas e algumas bactérias, mas ausente em mamíferos, como forma de abordar a busca por alvos terapêuticos relevantes para esta e outras micoses. Buscando caracterizar os genes e proteínas ligados ao ciclo do glioxilato, foi feita a identificação e anotação dos genes, a análise da organização genômica, a caracterização dos potenciais elementos regulatórios encontrados na região promotora destes genes em diferentes isolados de espécies do gênero Paracoccidioides. Ainda, foram realizadas caracterização e a modelagem da estrutura terciária das proteínas do Ciclo do Ácido Cítrico. Esta pesquisa contribuirá para uma compreensão mais profunda da biologia do Paracoccidioides brasiliensis e do Ciclo do Glioxilato, oferecendo insights para estudos futuros e o desenvolvimento de estratégias terapêuticas com o levantamento de potenciais inibidores para enzimas exclusivas do patógeno.
- ItemEstresse oxidativo pulmonar como alvo terapêutico do probiótico Lactobacillus rhamnosus em modelo murino de DPOC(Universidade Federal de São Paulo, 2023-12-06) Rosa, Paloma Cristina Silva [UNFESP]; Carvalho, Flávio Aimbire Soares de [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/8216583445045638; http://lattes.cnpq.br/4761096107869024OBJETIVO: Estudar o efeito do probiótico Lactobacillus rhamnosus (Lr) sobre o estresse oxidativo pulmonar em um modelo experimental de doença pulmonar obstrutiva crônica (DPOC) resistente ao corticóide. MÉTODOS: Camundongos C57Bl/6 machos com idade de 6-8 semanas foram divididos em 3 grupos experimentais (n=7/grupo experimental) descritos a seguir: controle (animais expostos ao ambiente sem fumaça), DPOC (animais expostos à fumaça de cigarro por 60 dias), Lr + DPOC (animais que receberam oralmente Lr 7 dias antes da indução da DPOC e até o fim do protocolo, totalizando 67 dias de tratamento). Todos os animais foram eutanasiados e o lavado broncoalveolar (LBA) foi coletado para análise da celularidade, de mediadores inflamatórios e de 8-isoprostano e 3-nitrotirosina. O pulmão esquerdo foi separado para morfometria, que analisou a infiltração neutrofílica, colágeno e alargamento alveolar. O pulmão direito foi usado para a realização do homogenato e, então, a análise de ROS, T-BARS, SOD, Catalase, GPx e T-BARS por ensaio de ELISA e para a análise da expressão de RNAm de NF-κB, NADPHoxidase, HO-1 e Nrf2 pela técnica de PCR. RESULTADOS: A administração de Lr modulou o estresse oxidativo a partir da redução de agentes oxidantes e da restauração da atividade antioxidante via Nrf2, e reduziu o alargamento alveolar. Além disso, o Lr atenuou a migração celular, a secreção de mediadores pró-inflamatórios e a expressão de NF-κB, a infiltração neutrofílica pulmonar, e a deposição de colágeno. CONCLUSÃO: Os resultados demonstram que o probiótico Lr é capaz de gerar um efeito protetor na DPOC por meio da modulação do estresse oxidativo.
- ItemDesenvolvimento de plataforma integrada para avanços em cana-de-açucar(Universidade Federal de São Paulo, 2023-12-08) Azevedo, Mateus Alves [UNIFESP]; Brito, Michael dos Santos [UNIFESP]; https://bv.fapesp.br/pt/pesquisador/87850/michael-dos-santos-brito/O desafio global relacionado ao aumento dos preços dos alimentos e da energia destaca a intrincada conexão entre segurança alimentar, energia e estabilidade política. Em resposta a essa crise, países como China e Índia implementaram medidas imediatas, como proibições de exportação e subsídios, levantando preocupações sobre consequências a longo prazo. No contexto brasileiro, a estabilidade nos mercados de petróleo e gás é vital, especialmente para um país de vastas dimensões como o Brasil. A segurança energética é essencial na mobilidade, transporte e geração de eletricidade. O projeto aborda a segurança energética por meio do estudo de novas ferramentas a serem aplicadas na produção de biocombustíveis, com foco na cana-de-açúcar, como matéria prima. A cana-de-açúcar é utilizada atualmente para a produção de etanol de primeira e segunda geração, destacando-se pela produção sustentável. A produção de bioetanol lignocelulósico enfrenta desafios, e a engenharia genética surge como uma ferramenta vital na otimização de cultivares de cana-de-açúcar. O desenvolvimento do projeto é fundamentado em bancos de dados de genética vegetal, como NCBI e Phytozome, permitindo acesso a informações cruciais para otimizar programas de melhoramento. O Laboratório de Biotecnologia Vegetal (Plantech) da Universidade Federal de São Paulo busca enfrentar desafios específicos relacionados à cana-de-açúcar. O acúmulo de dados motivou, bem como, o compartilhamento destes, motivou a criação de um banco de dados e, subsequentemente, a iniciativa de desenvolver um site para o Plantech. Esse site serve como um repositório acessível de sequências CDS, promovendo o arquivamento e a disseminação de resultados de pesquisas e fornecendo uma ferramenta essencial para a comparação de sequências, alinhando-se à temática de segurança energética. O trabalho detalha a importância dessa iniciativa para o avanço contínuo das pesquisas no Plantech e, a partir do êxito obtido, sua contribuição para a temática global de segurança energética, destacando a relevância do Brasil como protagonista nesse cenário.