Navegando por Palavras-chave "Bactéria"

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    Caracterização das proteases secretadas por Bacillus sp e encontradas no chorume obtidos da compostagem da fundação do parque zológico de São Paulo
    (Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 2017-01-31) Santos, Saara Maria Batista Dos [UNIFESP]; Juliano Neto, Luiz [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/6593457386037361; http://lattes.cnpq.br/0843281237524201; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
    Composting is defined as an active degradation process carried out by microrganisms in optimal conditions. The process can be divided into two distinct phases: the first is the thermophilic phase, which reaches approximately 45-65° C and the second stage involves maturation, resulting in the transformation in the humus material. From the prospect of composting Park Zoo Foundation of São Paulo in July 2013, it was possible to isolate and identify various microorganisms, where the genus Bacillus ssp accounted for 67% of the isolates. Of these, eight were separated Bacillus spp, and by biochemical tests, we observed enzymatic activity in the crude extract front substrates for proteases. The species were collected from a single compost: 3 species collected during the initial stage of degradation, 2 at the end of the process and other '3 between the two stages. The aim of this study was to investigate the biochemical profile of secreted proteases of the eight Bacillus isolates composting FPZSP. Achievements: enzyme activity tests were made with the FRET peptide substrate Abz-KLlSSKQ-EDDnp, secreted by the Bacillus culture in the presence of PMSF and EDTA inhibitors, which verified the presence of metal and serine proteases. Furthermore, the effect of the NaCI salt in the proteolytic activity of the secreted was also tested, where tolerance in concentrations of up to 5M was seen in some strains. The manure that runs through the composters was also separate in order to verify if there were any biochemical profile that percolate. Results: Enzyme activity was verified with the FRET-peptide substrates, which may be the same Bacillus enzymes secreted during the composting process.
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    Acesso aberto (Open Access)
    Caracterização ultraestrutural da parede de microrganismos sob ação do CPP AIP6
    (Universidade Federal de São Paulo, 2023-09-12) Souza, Louise Eloá Araújo [UNIFESP]; Silva, Emerson Rodrigo da [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/7800589206457326; http://lattes.cnpq.br/6243002423243007
    Introdução: O penta peptídeo RLRWR (AIP6) pertence ao grupo dos peptídeos de penetração celular (CPPs) mais curtos já reportados na literatura. A presença de argininas em sua composição confere grande cationicidade a esta sequência, tornando-a também candidata a apresentar propriedades antimicrobianas. Embora a interação de CPPs com células de mamífero seja amplamente investigada, estudos sobre os efeitos dessas moléculas sobre a parede celular de microrganismos não são realizados com a mesma intensidade. Nesta dissertação, investigamos a interação do peptídeo AIP6 com a parede celular de microrganismos-modelo utilizando técnicas de microscopia de força atômica (AFM) capazes de fornecer detalhes físico-químicos com resolução ultra alta. Desenvolvemos protocolos de análise que nos permitiram obter detalhes tridimensionais dessas interfaces, tanto em amostras fixadas quanto em células vivas mantidas em meio líquido. Também realizamos a caracterização da assinatura espectroscópica da parede em escala nanoscópica. Até onde temos conhecimento, trata-se da primeira vez que a ação de CPPs é avaliada por meio da combinação dessas técnicas de microscopia. Objetivo: obtenção de detalhes tridimensionais, em escala nanométrica, de paredes de procariotos e eucariotos submetidos à ação de um CPP. Além disso, também investigamos a assinatura espectroscópica dessas superfícies por meio da combinação de AFM com espectroscopia de infravermelho. Por fim, também pretendemos fornecer informações sobre o comportamento físico-químico do peptídeo e de sua capacidade de nanoestruturação. Materiais e métodos: O comportamento de nanoestruturação do peptídeo foi avaliado por fluorimetria, enquanto sua estrutura secundária foi avaliada por dicroísmo circular. Os modelos celulares procariotos foram as bactérias E. coli e B. subtilis, enquanto o modelo eucarioto foi a levedura S. cerevisiae. As células foram cultivadas em meios nutrientes padrão, sendo a concentração inibitória mínima (MIC) do AIP6 determinada pelo método de diluição seriada com análise de densidade ótica ao longo do tempo. Experimentos de AFM convencional e de nanoespectroscopia (AFM-IR) foram realizados em lâminas fixadas contendo células previamente incubadas com o peptídeo. Análises em células vivas foram realizadas em BioAFM.. Resultados e discussão: Foram encontradas MICs de 0.07 e 0.6 mg/mL, respectivamente, para bactérias Gram-positivas da espécie B. subtilis e Gram-negativas do tipo E. coli. As análises ultraestruturais da parede permitiram a observação de deformações, bem como a formação de domínios peptídicos foi identificada através da assinatura espectroscópica. No caso de células de levedura, não foram observadas grandes deformações, no entanto, verificamos em espectroscopia de infravermelho a aparição de várias vibrações que sugerem que o peptídeo estimula a produção de beta-glucanos em S. cerevisae. Conclusão: O peptídeo AIP6 mostrou afinidade pelas paredes celulares de bactérias, especialmente B. subtilis, enquanto não foi verificada ação antimicrobiana contra S. cerevisae. Nos procariotos, foi observada a formação de domínios peptídicos que provavelmente induzem a formação de poros. No caso de eucariotos, também foi verificada a formação de alguns domínios peptídicos, porém, em grau muito menor. Nesse caso, encontramos dados que sugerem que o AIP6 estimula a produção de beta-glucanos que recobrem a parede celular e facilitam a agregação entre células de levedura.
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    Comparação do efeito nas culturas de humor aquoso de gatifloxacina 0,3% aplicado três dias antes de facoemulsificação e e antes do pré-operatório
    (Sociedade Brasileira de Oftalmologia, 2011-02-01) Menezes, Paulo Augusto Hidalgo de; Hida, Wilson Takashi; Brasil, Alexandre Almeida; Peixoto, Diana Linhares Leins; Yamane, Iris de Souza; Vita Sobrinho, João Brasil [UNIFESP]; Nakano, Celso Takashi; Avakian, Amaryllis; Universidade de São Paulo (USP); Hospital Beneficência Portuguesa de São Paulo; Santa Casa de Misericórdia de São Paulo; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
    Purpose: To determine the effect on human aqueous humor cultures of topical gatifloxacin 0.3% applied four times a day three days before phacoemulsification compared to topical gatifloxaxin 0.3% applied and same-day surgery. METHODS: Thirty-seven patients with cataract without other ocular diseases were randomly assigned to Groups A and B before phacoemulsification. Group A received topical gatifloxacin 0.3% same-day surgery and Group B received gatifloxacin 0.3% four times a day three days before phacoemulsification. After the procedure the aqueous humor was aspirated for cultures on agar-blood, agar-chocolate, saboraud and TSB and smeared for bacterioscopy. RESULTS: Group A presented 40% of the bacterioscopies with cocci gram +, Group B presented 17.6% of the bacterioscopies with cocci gram +. These results are not statistically significant (p=0,098). Five cases (25%) from Group A presented positive cultures for S. epidermidis, which was significantly higher than Group B, which did not present positive cultures for any bacteria or fungus (p=0,027). CONCLUSION: Gatifloxacin 0.3% applied three days before phacoemulsification significantly lowered the rate of positive aqueous humor cultures when compared to immediate application of this antibiotic before surgery in this study.
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    Interação do glicopeptídeo Vancomicina em monocamadas de Langmuir como modelos de membrana celular
    (Universidade Federal de São Paulo, 2022-11-25) Santana, Heung Jin Alves [UNIFESP]; Caseli, Luciano [UNIFESP]; https://lattes.cnpq.br/8929162910172931
    Fármacos com atividade microbicida, responsáveis por tratar adversidades causadas por infecções bacterianas, são amplamente utilizados no meio médico e clínico e devem envolver em seu mecanismo de ação interações com as membranas que limitam a bactéria. Este trabalho teve como objetivo analisar a interação do fármaco vancomicina (VC), utilizado amplamente para tratar infecções bacterianas, com modelos de membrana utilizando monocamadas de Langmuir constituídas de lipídios. Estes filmes foram formados pelos fosfolipídios dipalmitoilfosfatidilcolina (DPPC) e dipalmitoilfosfatidilserina (DPPS) para estudar os efeitos da vancomicina com modelo de membrana de eritrócitos, e os fosfolipídios dipalmitoilfosfatiletalonamina (DPPE) para estudar os efeitos do fármaco em modelos de camada externa de membranas citoplasmáticas de bactérias. VC foi incorporada à monocamada lipídica a partir da subfase aquosa, e a interação fármaco-lipídio foi analisada por isotermas de pressão e potencial de superfície-área, microscopia no ângulo de Brewster e espectroscopia no infravermelho. Para efeitos de comparação, realizou-se ensaios com o bioativo puro, com cada lipídio puro e com os filmes mistos de VC-DPPC, VC-DPPE e VC-DPPS. Para o DPPC, a VC condensou a monocamada, a deixando menos estável quando previamente comprimidas até altas pressões. Para o DPPE, a VC deixou o filme mais estável, sinalizando uma expansão da monocamada, além da formação de agregados. Por fim, a vancomicina condensou a monocamada de DPPS, interagindo com suas regiões hidrofílicas. Concluímos que a interação da vancomicina com os modelos de membrana na interface ar-água é modulada pela composição lipídica, e depende das interações intermoleculares com o grupo polar das moléculas formadoras da monocamada.