Molecular identification of atlantic goliath grouper epinephelus itajara (lichtenstein, 1822) (perciformes: epinephelidae) and related commercial species applying multiplex pcr

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dc.contributor.authorDamasceno, Junio de Souza
dc.contributor.authorSiccha-Ramirez, Raquel
dc.contributor.authorOliveira, Claudio
dc.contributor.authorMendonça, Fernando Fernandes [UNIFESP]
dc.contributor.authorLima, Arthur da Costa
dc.contributor.authorMachado, Leonardo Francisco
dc.contributor.authorTosta, Vander Calmon
dc.contributor.authorFarro, Ana Paula Cazerta
dc.contributor.authorHostim-Silva, Mauricio
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
dc.date.accessioned2019-01-21T10:29:46Z
dc.date.available2019-01-21T10:29:46Z
dc.date.issued2016
dc.description.abstractThe Atlantic goliath grouper, Epinephelus itajara, is a critically endangered species, threatened by illegal fishing and the destruction of its habitats. A number of other closely related grouper species found in the western Atlantic are also fished intensively. While some countries apply rigorous legislation, illegal harvesting followed by the falsification of fish products, which impedes the correct identification of the species, is a common practice, allowing the catch to be marketed as a different grouper species. In this case, molecular techniques represent an important tool for the monitoring and regulation of fishery practices, and are essential for the forensic identification of a number of different species. In the present study, species-specific primers were developed for the Cytochrome Oxidase subunit I gene, which were applied in a multiplex PCR for the simultaneous identification of nine different species of Epinephelidae: Epinephelus itajara, E. quinquefasciatus, E. morio, Hyporthodus flavolimbatus, H. niveatus, Mycteroperca acutirostris, M. bonaci, M. marginata, and M. microlepis. Multiplex PCR is a rapid, reliable and cost-effective procedure for the identification of commercially-valuable endangered fish species, and may represent a valuable tool for the regulation and sustainable management of fishery resources.en
dc.description.abstractO mero, Epinephelus itajara , encontra-se criticamente ameaçado, resultado da pesca ilegal e destruição dos habitas. Filogeneticamente relacionadas a este táxon encontram-se garoupas que atualmente são intensamente pescadas no Atlântico Oeste. Apesar de leis mais restritivas aplicadas em alguns países, a captura ilegal com a descaracterização morfológica é uma prática comum que impossibilita a identificação correta da espécie permitindo que seja comercializada como garoupas, badejos ou chernes. A este respeito, técnicas moleculares representam ferramentas importantes para o monitoramento e fiscalização da pesca, provando ser essencial, na identificação forense de diversas espécies. Primers espécie-específicos foram desenvolvidos com base no gene Citocromo Oxidase subunidade I que aplicados em PCR-Multiplex possibilitam a identificação simultânea de nove espécies Epinephelidae: Epinephelus itajara , E. quinquefasciatus , E. morio , Hyporthodus flavolimbatus , H. niveatus , Mycteroperca acutirostris , M. bonaci , M. marginata e M. microlepis . A identificação via PCR multiplex de espécies de peixes ameaçadas e comercialmente importantes é um método rápido, prático, seguro e de baixo custo, que poderá ser útil o controle do uso e manejo sustentável de recursos pesqueiros.pt
dc.description.affiliationPrograma de Pós-graduação em Oceanografia Ambiental, Departamento de Oceanografia e Ecologia, Base Oceanográfica, Universidade Federal do Espírito Santo (UFES), Rodovia ES 10 km 16, 565, Coqueiral, 29199-970 Aracruz, ES, Brazil
dc.description.affiliationPrograma de Pós-graduação em Biologia de Vertebrados, Laboratório de Genética da Conservação, PUCMINAS - Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais, Av. Dom José Gaspar 500, Coração Eucarístico, 30535-901 Belo Horizonte, MG, Brazil
dc.description.affiliationLaboratório de Biologia e Genética de Peixes, Departamento de Morfologia, Instituto de Biociências de Botucatu, Universidade Estadual Paulista (UNESP), Distrito de Rubião Junior, s/n, 18618-000 Botucatu, SP, Brazil
dc.description.affiliationLaboratorio Costero de Tumbes, Instituto del Mar del Perú (IMARPE), Calle José Olaya S/N, Nueva Esperanza, Zorritos, TU, Perú
dc.description.affiliationDepartamento de Ciências do Mar, Instituto do Mar, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Av. Alm. Saldanha da Gama, 89, Ponta da Praia, 11030-400 Santos, SP, Brazil
dc.description.affiliationCosta Lima Aquicultura e Pesca, Praça Prefeito José Luiz da Costa, 27, Centro, 29960-000 Conceição da Barra, ES, Brazil
dc.description.affiliationUnifespDepartamento de Ciências do Mar, Instituto do Mar, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Av. Alm. Saldanha da Gama, 89, Ponta da Praia, 11030-400 Santos, SP, Brazil
dc.description.sourceWeb of Science
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)pt
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)pt
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Espirito Santo (FAPES)pt
dc.description.sponsorshipProjeto Meros do Brasil - Petrobras S.A.
dc.description.sponsorshipTranspetro Transportes S.A.
dc.description.sponsorshipIDThe Sistema de Autorizacao e Informacao em Biodiversidade (SISBIO) linked to the Instituto Chico Mendes de Conservacao da Biodiversidade (ICMBIO) of the Ministerio do Meio Ambiente (MMA) for licenses (SISBIO/ICMBIO/MMA No: 25088-7, authentication code 119228433 and No: 15080-2, authentication code: 84636263.
dc.format.extente150128
dc.identifierhttps://dx.doi.org/10.1590/1982-0224-20150128
dc.identifier.citationNeotropical Ichthyology. Sao paulo, v. 14, n. 3, p. e150128, 2016.
dc.identifier.doi10.1590/1982-0224-20150128
dc.identifier.fileS1679-62252016000300203.pdf
dc.identifier.issn1679-6225
dc.identifier.scieloS1679-62252016000300203
dc.identifier.urihttps://repositorio.unifesp.br/handle/11600/49381
dc.identifier.wosWOS:000385267900003
dc.language.isoeng
dc.publisherElsevier Science Inc
dc.relation.ispartofNeotropical Ichthyology
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectConservation Geneticsen
dc.subjectCoien
dc.subjectEndangered Speciesen
dc.subjectFishery Managementen
dc.subjectForensic GeneticsReal-Time Pcren
dc.subjectGenetic Identificationen
dc.subjectMaximum-Likelihooden
dc.subjectFish Filletsen
dc.subjectDnaen
dc.subjectConservationen
dc.subjectTradeen
dc.subjectFisheriesen
dc.subjectBrazilen
dc.subjectAuthenticationen
dc.titleMolecular identification of atlantic goliath grouper epinephelus itajara (lichtenstein, 1822) (perciformes: epinephelidae) and related commercial species applying multiplex pcren
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
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