Isolamento e identificação de micobactérias provenientes de água bruta e sistema de tratamento da Fundação Parque Zoológico de São Paulo

dc.contributor.advisorNiero, Cristina Viana [UNIFESP]pt
dc.contributor.authorBrianesi, Urze Adomaitis [UNIFESP]
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)pt
dc.date.accessioned2018-07-30T11:53:26Z
dc.date.available2018-07-30T11:53:26Z
dc.date.issued2013-02-12
dc.description.abstractA partir do ano 2000 foram descritas 80 novas espécies de micobactérias ambientais representando 48% das espécies do gênero Mycobacterium. Apesar do crescimento exponencial de descrição de novas espécies, estudos revelaram a existência de diversidade neste grupo de bactérias sugerindo a existência de espécies ainda não descritas. Este trabalho teve o objetivo de comparar métodos de descontaminação e cultivo de micobactérias provenientes de amostras de água bruta, água tratada e de efluente, identificar as micobactérias por características fenotípicas (pigmentação e velocidade de crescimento) e moleculares (PRA-hsp65 e sequenciamento de genes essenciais), e assim construir um banco de isolados e de DNA para preservação e estudos futuros. Pode-se demonstrar a importância de testar diferentes métodos de descontaminação para tipos distintos de amostras ambientais. A maior recuperação de micobactérias foi obtida após a descontaminação pelos métodos CPC 0,05% e SDS3%/NaOH1% de acordo com a menor e maior carga microbiana associada a amostra respectivamente. Foi possível isolar 371 micobactérias em 81% das amostras analisadas sendo que a maioria cresceu em 7H10-OADC-PANTA a 30°C e como características fenotípicas apresentaram-se como crescimento rápido e acromógenas. A identificação por PRA-hsp65 foi realizada em 292 isolados (78,7%) e todos geraram perfis de restrição com as enzimas BstEII e HaeIII mas apenas 55 isolados, 18,8%, foram identificados no nível de espécie. Duzentos e trinta e sete isolados (81,2%) apresentaram 159 perfis não descritos quando comparados ao banco de dados PRASITE demonstrando a necessidade de enriquecimento deste banco com perfis obtidos de amostras ambientais para que esta técnica possa ser útil também para identificação de micobactérias provenientes do meio ambiente. Vinte e quatro isolados foram analisados por sequenciamento de três genes essenciais (hsp65, rpoB e 16S rRNA) e os resultados apontaram para a possibilidade de descrição de novas espécies em quatro isolados (MCVA0078, MCVA0079, MCVA0101 e MCVA0102) que apresentaram porcentagem de identidade abaixo do ponto de corte quando comparado às sequências depositadas no banco de dados GenBank para todos os genes analisados.pt
dc.description.sourceDados abertos - Sucupira - Teses e dissertações (2013 a 2016)
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)pt
dc.description.sponsorshipIDFAPESP: 2010/52641-1pt
dc.description.sponsorshipIDFAPESP: 2011/13140-0pt
dc.format.extent81 p.
dc.identifierhttps://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=151593pt
dc.identifier.citationBRIANESI, Urze Adomaitis. Isolamento e identificação de micobactérias provenientes de água bruta e sistema de tratamento da Fundação Parque Zoológico de São Paulo. 2013. 81 f. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Ciências Ambientais, Químicas e Farmacêuticas, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Diadema, 2013.
dc.identifier.file2013-0031.pdf
dc.identifier.urihttp://repositorio.unifesp.br/handle/11600/48712
dc.language.isopor
dc.publisherUniversidade Federal de São Paulo
dc.rightsAcesso restrito
dc.subjectMicobactériaspt
dc.subjectÁguapt
dc.subjectPRA-hsp65pt
dc.subjectSequenciamento de genes essenciaispt
dc.subjectBiodiversidadept
dc.titleIsolamento e identificação de micobactérias provenientes de água bruta e sistema de tratamento da Fundação Parque Zoológico de São Paulopt
dc.typeDissertação de mestrado
unifesp.campusInstituto de Ciências Ambientais, Químicas e Farmacêuticas (ICAQF)pt
unifesp.graduateProgramBiologia Químicapt
unifesp.knowledgeAreaBiologia Químicapt
unifesp.researchAreaBiologia de Microorganismos e das Interações Celularespt
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