Isolamento e identificação de micobactérias provenientes de água bruta e sistema de tratamento da Fundação Parque Zoológico de São Paulo

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dc.contributor.advisorNiero, Cristina Viana [UNIFESP]pt
dc.contributor.authorBrianesi, Urze Adomaitis [UNIFESP]
dc.contributor.institutionUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)pt
dc.date.accessioned2018-07-30T11:53:26Z
dc.date.available2018-07-30T11:53:26Z
dc.date.issued2013-02-12
dc.description.abstractA partir do ano 2000 foram descritas 80 novas espécies de micobactérias ambientais representando 48% das espécies do gênero Mycobacterium. Apesar do crescimento exponencial de descrição de novas espécies, estudos revelaram a existência de diversidade neste grupo de bactérias sugerindo a existência de espécies ainda não descritas. Este trabalho teve o objetivo de comparar métodos de descontaminação e cultivo de micobactérias provenientes de amostras de água bruta, água tratada e de efluente, identificar as micobactérias por características fenotípicas (pigmentação e velocidade de crescimento) e moleculares (PRA-hsp65 e sequenciamento de genes essenciais), e assim construir um banco de isolados e de DNA para preservação e estudos futuros. Pode-se demonstrar a importância de testar diferentes métodos de descontaminação para tipos distintos de amostras ambientais. A maior recuperação de micobactérias foi obtida após a descontaminação pelos métodos CPC 0,05% e SDS3%/NaOH1% de acordo com a menor e maior carga microbiana associada a amostra respectivamente. Foi possível isolar 371 micobactérias em 81% das amostras analisadas sendo que a maioria cresceu em 7H10-OADC-PANTA a 30°C e como características fenotípicas apresentaram-se como crescimento rápido e acromógenas. A identificação por PRA-hsp65 foi realizada em 292 isolados (78,7%) e todos geraram perfis de restrição com as enzimas BstEII e HaeIII mas apenas 55 isolados, 18,8%, foram identificados no nível de espécie. Duzentos e trinta e sete isolados (81,2%) apresentaram 159 perfis não descritos quando comparados ao banco de dados PRASITE demonstrando a necessidade de enriquecimento deste banco com perfis obtidos de amostras ambientais para que esta técnica possa ser útil também para identificação de micobactérias provenientes do meio ambiente. Vinte e quatro isolados foram analisados por sequenciamento de três genes essenciais (hsp65, rpoB e 16S rRNA) e os resultados apontaram para a possibilidade de descrição de novas espécies em quatro isolados (MCVA0078, MCVA0079, MCVA0101 e MCVA0102) que apresentaram porcentagem de identidade abaixo do ponto de corte quando comparado às sequências depositadas no banco de dados GenBank para todos os genes analisados.pt
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2018-07-30T11:53:26Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-12en
dc.description.sourceDados abertos - Sucupira - Teses e dissertações (2013 a 2016)
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)pt
dc.description.sponsorshipIDFAPESP: 2010/52641-1pt
dc.description.sponsorshipIDFAPESP: 2011/13140-0pt
dc.format.extent81 p.
dc.identifierhttps://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=151593pt
dc.identifier.citationBRIANESI, Urze Adomaitis. Isolamento e identificação de micobactérias provenientes de água bruta e sistema de tratamento da Fundação Parque Zoológico de São Paulo. 2013. 81 f. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Ciências Ambientais, Químicas e Farmacêuticas, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Diadema, 2013.
dc.identifier.file2013-0031.pdf
dc.identifier.urihttp://repositorio.unifesp.br/handle/11600/48712
dc.language.isopor
dc.publisherUniversidade Federal de São Paulo
dc.rightsAcesso restrito
dc.subjectMicobactériaspt
dc.subjectÁguapt
dc.subjectPRA-hsp65pt
dc.subjectSequenciamento de genes essenciaispt
dc.subjectBiodiversidadept
dc.titleIsolamento e identificação de micobactérias provenientes de água bruta e sistema de tratamento da Fundação Parque Zoológico de São Paulopt
dc.typeDissertação de mestrado
unifesp.campusInstituto de Ciências Ambientais, Químicas e Farmacêuticas (ICAQF)pt
unifesp.graduateProgramBiologia Químicapt
unifesp.knowledgeAreaBiologia Químicapt
unifesp.researchAreaBiologia de Microorganismos e das Interações Celularespt
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