Investigação das bases moleculares do câncer não medular familiar da tireoide
Nenhuma Miniatura disponível
Data
2018-12-20
Autores
Lima, Erika Urbano de [UNIFESP]
Orientadores
Rubio, Ileana Gabriela Sanchez de [UNIFESP]
Tipo
Tese de doutorado
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Resumo
Almost 95% of thyroid cancer cases originate from follicular thyroid cells
(NMTC). The majority are sporadic (90%), but 3-9% correspond to familial forms
(FNMTC) characterized by three or more first-degree relatives affected by thyroid
cancer. It can be divided into different subgroups: familial papillary thyroid carcinoma
(PTC) with or without oxyphilia cell, familial PTC with papillary renal cell carcinoma,
and familial PTC with multinodular goiter. Some chromosomal loci and genes were
associated with CNMFT in families with specific phenotypes. It has been proposed that
FNMTC may be a polygenic disease with autosomal dominant inheritance with variable
penetrance. The objective of this study was to identify genetic variants involved in the
susceptibility to FNMTC in two Brazilian families using Whole Exome Sequencing
(WES) and specific bioinformatics analyses. WES of DNA samples from peripheral
blood leukocyte was performed using SureSelectXT Human All Exon V6+UTR Capture
Library kit (Agilent) and the Illumina® NextSeq ™ 500 platform. For the variants
selection an extensive bioinformatics analysis was performed using 12 specific
programs and 4 population databases (ExAc, AbraOM, dbSNP and Ensembl). In the
first family from Manaus (Amazonas) and characterized as familial PTC with
multinodular goiter, the c.C110A variant of the ACTL8 gene was exclusively present in
all affected individuals. The analysis showed that the ACTL8 variant may impair the
protein function and structure, and that this protein could interact with the cytoskeleton
and epithelial differentiation proteins. The c.C623T and c.C2654T variants of the
SRPX2 and EPHB1 genes were identified in the second family from Jacobina (Bahia)
classified as familial PTC without oxyphilic cells. Both variants were classified as
damaging in all prediction analyzes and the joint presence of these variants showed
increased odds ratio to develop the disease (OR= 51; 95% CI: 1.7046 - 1525.9024;
P=0.0234), with 100% of sensitivity and 88.9% of specificity. It was also was observed
that both proteins (SRPX2 and EPHB1) would participate in a network of protein
interactions related to MAPK pathway activation.These results suggest that the
ACTL8, SRPX2 and EPBH1 genes variants identified in this study confer susceptibility
to the development of FNMTC in these particular families. These results are in
agreement with the literature that suggests that the genetic factors of FNMTC
susceptibility are specific to each family.
Aproximadamente 95% dos casos de câncer da tireoide se originam em células foliculares (CNMT). A grande maioria são esporádicos (90%), porém de 3-9% correspondem as formas familiares (CNMFT), caracterizadas pela existência de três ou mais familiares de primeiro grau afetados pelo câncer da tireoide. Pode ser dividido em diferentes subgrupos: carcinoma papilífero da tireoide (CPT) familiar com ou sem a presença de células oxifilias, CPT familiar com tumor papilar renal e CPT familiar com bócio multinodular. Alguns locus cromossômicos e genes foram associados a famílias com fenótipos específicos de CNMFT. Acredita-se que possa ser uma doença poligênica com herança autossômica dominante e penetrância variável. O objetivo deste estudo foi identificar variantes genéticas envolvidas na predisposição ao CNMFT em duas famílias brasileiras utilizando o sequênciamento do exoma (Whole Exome Sequencing - WES) e análises específicas de bioinformática. Para o WES de amostras de DNA de leucócitos do sangue periférico foi utilizando o kit SureSelectXT Human All Exon V6+UTR Capture Library (Agilent) e a plataforma Illumina® NextSeq™500. Para a seleção das variantes foi realizada uma extensa análise de bioinformática utilizando 12 programas específicos e 4 bancos de dados populacionais (ExAc, AbraOM, dbSNP e Ensembl). Na primeira família, oriunda da cidade de Manaus (Amazonas) e caracterizada como CPT familiar com bócio multinodular foi identificada a variante c.C110A do gene ACTL8, presente exclusivamente em todos os indivíduos afetados. As análises mostraram que a variante do gene ACTL8 pode prejudicar a função e estrutura protéica, a qual pode interagir com proteínas de citoesqueleto e de diferenciação epitelial. Na segunda família oriunda da cidade de Jacobina (Bahia) e classificada como CPT familiar sem células oxifílicas foram identificadas as variantes c.C623T e c.C2654T dos genes SRPX2 e EPHB1. Ambas variantes foram classificadas como prejudiciais em todas as análises de predição e a presença conjunta destas mostrou aumento da razão de chances para desenvolver a doença (OR= 51; 95% IC: 1,7046 - 1525,9024; P=0.0234), com sensibilidade de 100% e especificidade de 88,9%. Também foi observado que ambas proteínas (SRPX2 e EPHB1) participariam de uma rede de interações relacionada à ativação da via MAPK. Estes resutados sugerem que as variantes dos genes ACTL8, SRPX2 e EPBH1 identificadas neste estudo conferem susceptibilidade para o desenvolvimento do CNMF nestas famílias em particular. Estes resultados vão de encontro com a literatura que sugere que os fatores genéticos de suceptibilidade do CNMFT são específicos para cada família.
Aproximadamente 95% dos casos de câncer da tireoide se originam em células foliculares (CNMT). A grande maioria são esporádicos (90%), porém de 3-9% correspondem as formas familiares (CNMFT), caracterizadas pela existência de três ou mais familiares de primeiro grau afetados pelo câncer da tireoide. Pode ser dividido em diferentes subgrupos: carcinoma papilífero da tireoide (CPT) familiar com ou sem a presença de células oxifilias, CPT familiar com tumor papilar renal e CPT familiar com bócio multinodular. Alguns locus cromossômicos e genes foram associados a famílias com fenótipos específicos de CNMFT. Acredita-se que possa ser uma doença poligênica com herança autossômica dominante e penetrância variável. O objetivo deste estudo foi identificar variantes genéticas envolvidas na predisposição ao CNMFT em duas famílias brasileiras utilizando o sequênciamento do exoma (Whole Exome Sequencing - WES) e análises específicas de bioinformática. Para o WES de amostras de DNA de leucócitos do sangue periférico foi utilizando o kit SureSelectXT Human All Exon V6+UTR Capture Library (Agilent) e a plataforma Illumina® NextSeq™500. Para a seleção das variantes foi realizada uma extensa análise de bioinformática utilizando 12 programas específicos e 4 bancos de dados populacionais (ExAc, AbraOM, dbSNP e Ensembl). Na primeira família, oriunda da cidade de Manaus (Amazonas) e caracterizada como CPT familiar com bócio multinodular foi identificada a variante c.C110A do gene ACTL8, presente exclusivamente em todos os indivíduos afetados. As análises mostraram que a variante do gene ACTL8 pode prejudicar a função e estrutura protéica, a qual pode interagir com proteínas de citoesqueleto e de diferenciação epitelial. Na segunda família oriunda da cidade de Jacobina (Bahia) e classificada como CPT familiar sem células oxifílicas foram identificadas as variantes c.C623T e c.C2654T dos genes SRPX2 e EPHB1. Ambas variantes foram classificadas como prejudiciais em todas as análises de predição e a presença conjunta destas mostrou aumento da razão de chances para desenvolver a doença (OR= 51; 95% IC: 1,7046 - 1525,9024; P=0.0234), com sensibilidade de 100% e especificidade de 88,9%. Também foi observado que ambas proteínas (SRPX2 e EPHB1) participariam de uma rede de interações relacionada à ativação da via MAPK. Estes resutados sugerem que as variantes dos genes ACTL8, SRPX2 e EPBH1 identificadas neste estudo conferem susceptibilidade para o desenvolvimento do CNMF nestas famílias em particular. Estes resultados vão de encontro com a literatura que sugere que os fatores genéticos de suceptibilidade do CNMFT são específicos para cada família.