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    Acesso aberto (Open Access)
    Bioprospecção de substâncias com potencial anticâncer em organismos marinhos
    (Universidade Federal de São Paulo, 2023-12-07) Pereira, Ana Clara Magnusson Assis [UNIFESP]; Gozzo, Andrezza Justino [UNIFESP]; Jimenez, Paula Christine [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/4248251483705135; http://lattes.cnpq.br/8319213412361992; https://lattes.cnpq.br/9368043636380577; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
    O oceano possui uma alta biodiversidade que ainda não é totalmente conhecida pelo ser humano, já que sua vastidão e profundidade produz muitos desafios para a tecnologia. Porém, nestas últimas décadas, a pesquisa acerca deste ecossistema se intensificou a ponto de podermos enxergar os benefícios da pesquisa marinha, como a bioprospecção de substâncias para o desenvolvimento de fármacos. Substâncias com potencial anticâncer no ambiente marinho vem sendo aprovadas para o tratamento dessa doença desde o século passado, mostrando o constante crescimento desse campo de pesquisa. Entre os organismos marinhos, destacam-se os microrganismos, já que possuem estratégias metabólicas únicas, produzindo compostos bioativos que podem ser utilizados, por exemplo, como agentes antitumorais. Os inibidores de protease podem ser grandes aliados na prospecção do potencial anticâncer, já que as proteases estão envolvidas no processo de aumento e na progressão de células tumorais, tanto em locais primários quanto em metástase. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi bioprospectar bactérias do mar profundo contendo inibidores de proteases com potencial anticâncer. Para isso, foram verificadas as atividades inibitórias dos extratos de bactérias sobre a serinoprotease tripsina e a cisteinoprotease papaína. As cepas do mar profundo que apresentaram uma maior atividade inibitória sobre as duas classes de enzimas foram a BRB-313 e BRB-318, pertencentes ao gênero Streptomyces sp. Em conclusão, a pesquisa marinha emergiu como uma valiosa fonte de descobertas, revelando segredos profundos do oceano e desvendando potenciais terapêuticos no combate ao câncer. O estudo das bactérias do mar profundo destaca-se como uma promissora fronteira na busca por inibidores de proteases com potencial anticâncer, oferecendo perspectivas esperançosas para o desenvolvimento futuro de tratamentos inovadores.
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    Acesso aberto (Open Access)
    Composição das assembleias de nemátodas associadas a carcaças de baleia no Oceano Atlântico Sudoeste
    (Universidade Federal de São Paulo, 2021-02-24) Ávila, Ana Karoline Frutuoso de [UNIFESP]; Gallucci, Fabiane [UNIFESP]; Shimabukuro, Maurício; http://lattes.cnpq.br/6687279161358847; http://lattes.cnpq.br/8179208642568772; http://lattes.cnpq.br/6570647372763285; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
    As carcaças de baleia proporcionam enriquecimento orgânico essencial para o ecossistema de mar profundo, suportando uma densa comunidade de organismos oportunistas e especialistas neste tipo de ambiente. A carcaça pode passar por pelo menos três estágios sucessionais denominados de necrófagos móveis, estágio de enriquecimento oportunista e estágio sulfofílico. A grande disponibilidade de alimento proporcionada pela carcaça suporta o desenvolvimento de condições redutoras de modo que a fauna colonizadora durante o estágio sulfofílico da carcaça se assemelha a fauna de outros ambientes quimiossintetizantes de mar profundo. O objetivo deste estudo foi descrever a composição das assembleias de nemátodas marinhos de vida livre associadas a ossos de baleia implementados experimentalmente a 1500 metros e 3300 metros de profundidade no oceano Atlântico Sudoeste, e compará-las a outros ambientes de mar profundo, incluindo ambientes redutores e sedimento adjacente à área de estudo. As assembléias de carcaças implantadas a 1500 metros de profundidade foram dominadas pelo gênero Halomonhystera, que representou mais de 90% da abundância total. Já os pontos mais profundos, tiveram contribuição expressiva do gênero Paranticoma, à exceção do ponto SP-3300, que de modo similar às estações mais rasas foi dominada pelo gênero Halomonhystera. Essa variação entre os pontos de implementação das carcaças foi associada a processos oceanográficos, representados por duas massas de água no local: a Água Profunda do Atlântico Norte, que flui em direção ao Sul na região rasa (1500 metros) e a Água de Fundo Antártica, que flui em direção ao Norte na região mais profunda (3300 metros). O estudo ainda apontou que as assembleias das carcaças são bem diferentes daquelas presentes nos sedimentos adjacentes e demais ambientes de mar profundo. Porém, as assembleias de nemátodas presentes nas carcaças de baleia apresentaram grande similaridade com ambientes redutores, como exsudações frias e fontes hidrotermais, suportando a hipótese de que carcaças de baleia podem servir como ambientes intermediários para fins de dispersão da fauna dependente de ambientes de quimiossíntese, destacando a importância de ilhas orgânicas para a compreensão da conectividade e filogenia de organismos no mar profundo.
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    Meiofauna associada a ilhas orgânicas no Oceano Atlântico Sudoeste
    (Universidade Federal de São Paulo, 2023-09-27) Ávila, Ana Karoline Frutuoso de [UNIFESP]; Gallucci, Fabiane [UNIFESP]; Shimabukuro, Maurício; http://lattes.cnpq.br/6687279161358847; http://lattes.cnpq.br/8179208642568772; http://lattes.cnpq.br/6570647372763285; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
    Quedas orgânicas, como carcaças de baleia e parcelas de madeira, têm sido investigadas há muitas décadas no mar profundo. Esses ambientes efêmeros são importantes para o ambiente oligotrófico do mar profundo, abrigando uma densa fauna oportunista e especializada. Vários estudos com foco em macro invertebrados têm se dedicado a descrever e comparar quedas orgânicas, com o intuito de compreender como esses ambientes são colonizados, explorando sua diversidade e os fatores que moldam a estrutura das comunidades. Embora alguns estudos relatem a presença de organismos da meiofauna como parcela significativa da fauna colonizadora de substratos orgânicos, poucos esforços foram empreendidos para aprofundar nossa compreensão da dinâmica de colonização e da composição dessas comunidades em quedas orgânicas. Nesse contexto, a atual dissertação tem por objetivo investigar a meiofauna associada a ossos de baleia e parcelas de madeira experimentalmente implantadas em diferentes profundidades, bem como uma carcaça natural encontrada a 4204 m de profundidade no Oceano Atlântico Sudoeste profundo. Dessa forma, a dissertação foi estruturada em três capítulos, complementados pela introdução ao tema e pelas considerações finais do trabalho. O capítulo 1 tem como enfoque principal a investigação da meiofauna, em particular as assembleias de Nematoda colonizadoras de ossos implantados a 1500 e 3300 metros em diferentes latitudes, e de uma carcaça natural encontrada a 4204 metros, e compará-las às assembleias de Nematoda de outros ambientes de mar profundo. Este capítulo mostra que as assembleias de Nematoda associadas a vértebras de baleia se assemelham àquelas presentes em fontes hidrotermais e locais de exsudações frias. Diferenças entre as carcaças implantadas em diferentes profundidades e também a carcaça natural indicam também que as condições oceanográficas e o tempo de deposição da carcaça no fundo do oceano podem influenciar a composição e a riqueza das assembleias de Nematoda em ilhas orgânicas no mar profundo. A segunda parte da dissertação (Capítulos 2 e 3) amplia a abrangência das investigações sobre a meiofauna em ilhas orgânicas no Oceano Atlântico Sudoeste para uma área mais rasa na região sul da Bacia de Santos, e adiciona o substrato madeira, a fim de ampliar nossa compreensão dos processos de colonização e dispersão da meiofauna nesses ambientes. Assim, o Capítulo 2 tem por objetivo descrever as assembleias de Nematoda colonizadoras de parcelas de madeira e ossos de baleia implantados a 550 metros de profundidade no Oceano Atlântico Sudoeste. As assembleias de Nematoda colonizaram ambos os substratos e apresentaram assembleias com baixa riqueza de gêneros e a dominância de gêneros únicos, compartilhando fauna com outros ambientes quimiossintéticos. Dessa forma, este capítulo apresenta novos resultados que suportam evidências de que ambientes efêmeros e outros ambientes quimiossintéticos amplamente distribuídos podem desempenhar um papel importante na colonização e dispersão de gêneros específicos no mar profundo. Por fim, no Capítulo 3, são apresentadas observações sobre o processo de colonização de ossos de baleia em relação às condições de degradação do substrato. Este capítulo evidencia que tanto as condições de degradação quanto às interações bióticas têm o potencial de influenciar a estrutura da meiofauna em substratos orgânicos. Dessa forma, esta dissertação contribui para conhecimento das estruturas das comunidades colonizadoras de substratos orgânicos, em especial a meiofauna, e sua importância para a diversidade e conectividade no mar profundo. Sugerindo que ilhas orgânicas potencialmente atuem como um importante ambiente intermediário para dispersão e evolução de organismos meiofaunais associados a ambientes quimiossintéticos no mar profundo, particularmente no Oceano Atlântico Sudoeste.
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    Acesso aberto (Open Access)
    On the importance of functional traits and of phylogenetic relationships in marine nematodes: eco-evolutionary perspectives
    (Universidade Federal de São Paulo, 2022-09-23) Johnson da Silva, William [UNIFESP]; Fonseca, Gustavo [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/2643979959364811; http://lattes.cnpq.br/1055946306253948; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
    As espécie possuem diversas características que as permitem explorar determinados nichos, exercendo e sofrendo influência nas inúmeras relações e processos ecológicos que ocorrem nos ecossistemas. Essas características podem ser, por exemplo, de natureza funcional, filogenética ou comportamental, e ao longo do tempo evolutivo estruturam a forma como as comunidades são hoje. Embora estudos ecológicos utilizando atributos funcionais e a posição filogenética das espécies de Nematoda marinhos sejam comuns, algumas estruturas morfológicas dos Nematoda recebem termos ambíguos. Além disso, a integração dos atributos funcionais e filogenéticos a medidas como amplitude (NB) e posição dos nichos (NP) das espécies ainda é incipiente, e entender este panorama é crucial para a compreensão da história evolutiva e da dinâmica das comunidades. Esse entendimento é ainda mais relevante em ambientes com alta diversidade como o mar profundo. Desta forma, este trabalho teve como objetivo entender se atributos funcionais e filogenéticos podem predizer a amplitude e posição dos nichos das espécies de Nematoda. Para isto, investigamos organismos coletados na Bacia de Santos, SP - Brasil e separamos os termos traços funcionais (aqueles com relação ao funcionamento do ecossistema) de morfologia funcional (aqueles com influência na performance individual do organismo. Comprimento/largura (L/W), forma do corpo, estratégia trófica, tipo de cauda e estratégia de vida são compreendidos como traços funcionais. Ao passo que anfídeo, cutícula e setas somáticas podem ser consideradas morfologias funcionais. Os caracteres funcionais, juntamente com a posição filogenética, e o ambiente de ocorrência (plataforma continental ou mar profundo) foram utilizados para prever os nichos da espécie a partir do método de Random Forest. Agrupamos as 50 espécies de Nematoda em 4 grupos de acordo com as similiaridades da amplitude (NB) e posição de nicho (NP). O modelo demonstrou que a taxa de acurácia para os grupos e para cada espécie depende do ambiente. As espécies de mar profundo são mais previsíveis do que as da plataforma continental. Os atributos funcionais mais importantes revelados pelo modelo foram o tipo de cauda móvel e hemi-sésseis, e as formas de corpo escavadoras e intermediárias. Estes traços ocorreram em espécies muitas vezes distantes filogeneticamente, mas que têm características que convergem para determinadas funções, evidenciando um processo de convergência evolutiva, sobretudo em regiões profundas. Nas regiões rasas, por outro lado, os traços funcionais não foram suficientes para predizer os o grupo das espécies, e muitas vezes nem em combinação com os filogenéticos. Dessa forma, nossos resultados mostram que distintos processos evolutivos ocorrem entre a plataforma e o mar profundo, e que a heterogeneidade do habitat atrelada às variações dos traços entre as espécies pode ser responsável por esta distinção entre os processos.