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    Antimicrobial resistance among Gram-negative bacilli isolated from Latin America: results from SENTRY Antimicrobial Surveillance Program (Latin America, 2008-2010)
    (Elsevier B.V., 2012-08-01) Gales, Ana C. [UNIFESP]; Castanheira, Mariana; Jones, Ronald N.; Sader, Helio S. [UNIFESP]; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP); JMI Labs
    This study updates the frequency and resistance rates of Gram-negative bacilli isolated from Latin American medical centers enrolled in the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program. A total of 12,811 bacterial organisms, including 5704 Gram-negative bacilli (44.5%), were consecutively collected (1 per patient) between January 2008 and December 2010 from 10 Latin American medical centers located in Argentina, Brazil, Chile, and Mexico. Antimicrobial susceptibility testing was performed and interpreted by the Clinical and Laboratory Standards Institute broth microdilution method at a central laboratory. All Gram-negative organisms with reduced susceptibility to imipenem or meropenem (MIC, >= 2 mu g/mL) were screened for carbapenemase production by the modified Hodge test and by polymerase chain reaction. ESBL rates were 18.1%, 12.8%, 23.8%, and 48.4% among Escherichia coli and 60.4%, 49.9%, 59.2%, and 33.3% among Klebsiella spp. from Argentina, Brazil, Chile, and Mexico, respectively. Meropenem-nonsusceptible Klebsiella spp. rate was highest in Brazil (11.1%), followed by Argentina (8.2%), Chile (5.0%), and Mexico (0.8%). Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)-producing K. pneumoniae was not detected in 2008, but emerged in 2009 (10 strains) and increased significantly in 2010 (44: P < 0.0001). bla(KPC-2) was detected in 54 (65.9%) of 85 carbapenem-nonsusceptible K. pneumoniae. Meropenem-nonsusceptible P. aeruginosa was observed in 53.8%, 46.7%, 33.3%, and 28.8% of strains from Argentina, Brazil, Chile, and Mexico, respectively. Imipenem-resistant Acinetobacter spp. rates increased from 6.4%, 12.6%, and 0.0% in the 1997-1999 period to 84.9%, 71.4%, and 50.0% in 2008-2010 in Argentina, Brazil, and Chile, respectively. Oxacillinase (OXA)-producing Acinetobacter spp. was documented in Argentina (OXA-23 and -24), Brazil (0)(A-23), Chile (OXA-58), and Mexico (OXA-24). Only colistin showed >77% overall coverage against the 5 most frequently isolated Gram-negative bacilli from Latin American Medical centers participating in the SENTRY Program. (C) 2012 Elsevier Inc. All rights reserved.
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    Características clinicas e fatores de risco associados a letalidade de pacientes com infecções da corrente sanguínea por Acinetobacter spp
    (Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 1996) Correa, Luci [UNIFESP]; Wey, Sergio Barsanti [UNIFESP]
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    Caracterizacao dos mecanismos de resistencia aos carbapenens e analise da similaridade genetica de amostras de Acinetobacter spp. isoladas do Hospital São Paulo no periodo de 1993 a 2001
    (Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 2004) Tognim, Maria Cristina Bronharo [UNIFESP]
    Objetivo: O presente estudo teve como objetivo caracterizar os mecanismos de resistencia aos carbapenens e analisar a similaridade genetica de amostras de Acinetobacter spp. isoladas em diferentes unidades clinicas do Hospital São Paulo no periodo de 1993 a 2001. Metodos: Setenta e tres amostras de Acinetobacter spp. com sensibilidade reduzida aos carbapenens confirmadas pelo metodo de disco difusao foram avaliadas. Todas as amostras foras submetidas ao testes de sensibilidade ao agentes antimicrobianos pela metodologia de microdiluicao em caldo de acordo com a padronizacao do NCCLS. Para a pesquisa fenotipica da producao de metalo -lactamase (ML) do grupo 3, classe molecular B, foi utilizado como triagem o teste de aproximacao de discos utilizando como substrados imipenem e ceftazidima e como inibidores o EDTA e o acido 2-mercaptopropionico. A confirmacao fenotipica da producao de ML foi realizada pela metodologia de Etest® ML. A deteccao dos genes blaIMP, blaVIM, blaSPM, e blaOXA-23 a OXA-27 foi realizada pela tecnica de PCR. Os respectivos amplicons obtidos foram clivados com as enzimas de restricao EcoRI, BamHI e HindIII e selecionados posteriormente para o sequenciamento. Outros mecanismos de resistencia foram pesquisados em 21 amostras de Acinetobacter spp. com ribogrupos distintos. A pesquisa fenotipica da hiperproducao de AmpC e da presenca de bomba de efluxo, foi realizada pela tecnica de diluicao em agar utilizando-se -lactamicos com e sem inibidores SYN 2190 e reserpina respectivamente. A avaliacao do perfil de proteinas de membrana externa foi realizada pela tecnica de SDS-PAGE. A similaridade genetica entre as 73 amostras resistentes aos carbapenens foi avaliada pela tecnica da ribotipagem automatizada. Resultados: A polimixina E (MIC50,  0,5 g/ml; 97,3 por cento de sensibilidade), ampicilina-sulbactam (MIC50,  8,0 g/ml; 74 por cento de sensibilidade) e gatifloxacina (MIC50,  2,0 g/ml; 53,4 por cento de sensibilidade) foram os antimicrobianos com maior atividade in vitro contra amostras de Acinetobacter spp. estudadas. Quarenta das 73 (54,8 por cento) amostras de Acinetobacter spp. foram categorizadas como produtoras de ML pelos testes fenotipicos utilizados para deteccao da producao dessas enzimas. Estas amostras apresentaram produto de amplificacao de PCR positivo para o gene blaIMP. Como os amplicons produzidos pelas 40 amostras apresentaram o mesmo padrao de clivagem, somente duas amostras foram aleatoriamente selecionadas) para o sequenciamento. O produto doa(au)
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    Caracterização molecular de isolados pertencentes ao complexo Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii obtidos de amostras clínicas e ambientais
    (Universidade Federal de São Paulo, 2022-05-27) Alves, Rebeca Lobato [UNIFESP]; Minarini, Luciene Andrade da Rocha [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/5226657617185982; http://lattes.cnpq.br/2680532753717514
    Este estudo teve como objetivo caracterizar molecularmente isolados de Acinetobacter spp. obtidos de amostras clínicas de pacientes atendidos no Hospital Municipal e em Serviços de Saúde na comunidade de Diadema, no período de maio a dezembro de 2019, e de importantes reservatórios de água da Região Metropolitana de São Paulo em 2021. A identificação dos isolados clínicos e ambientais foi realizada por MALDI-TOF MS e a concentração inibitória mínima para os principais antimicrobianos foi determinada por diluição em ágar. Os genes que codificam mecanismos de resistência aos β-lactâmicos, incluindo carbapenêmicos, determinantes plasmidiais de resistência à colistina e às quinolonas foram investigados por PCR. A análise de similaridade genética foi realizada por REP-PCR. Ao todo, 53 isolados clínicos pertencentes ao complexo Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii foram incluídos no estudo, sendo 52 A. baumannii e um A. pittii. Foi observado 86,79% e 22,65% de isolados resistente ao imipenem e à colistina, respectivamente. A maior parte dos isolados clínicos (41, 83,68%) foi obtida de pacientes internados no Hospital Municipal, causando principalmente infecções no trato respiratório inferior (14, 26,42%). Os genes encontrados foram blaOXA-23-like, blaOXA-24/40-like, em 32 (60,37%) e 16 (30,18%) isolados, respectivamente. O gene blaOXA-51-like foi detectado em todos os isolados identificados como A. baumannii. Além disso, foram evidenciados 20 grupos clonais nos isolados clínicos do complexo. Nas amostras de água, 25 isolados de Acinetobacter spp. foram recuperados, sendo sete A. calcoaceticus, dois A. pittii, um A. baumannii e 15 A. baylyi. Os isolados de água foram provenientes de um único ponto de coleta da Represa Billings. Ao todo, 14 isolados de A. baylyi apresentaram o gene blaOXA-24/40-like, dos quais 12 demonstraram resistência ao imipenem. Além disso, cinco isolados de A. baylyi apresentaram genes de resistência às quinolonas, sendo o gene qnrA o mais frequente. Os resultados obtidos nesse estudo reforçam a necessidade de manter constante vigilância e o monitoramento dos isolados de Acinetobacter spp.
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    Deteccao do modo de disseminacao da resistencia a polimixina B em amostras de Acinetobacter spp
    (Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 2001) Luz, Deise Aparecida Mota [UNIFESP]
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    Dinâmica da resistência aos β-lactâmicos em amostras clínicas de Acinetobacter spp. isolados no Brasil e na Espanha
    (Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 2012) Cayô, Rodrigo [UNIFESP]; Gales, Ana Cristina [UNIFESP]
    Durante mais de quatro decadas o genero Acinetobacter sofreu com as constantes modificacoes na sua taxonomia o que atrasou o conhecimento da epidemiologia das especies pertencentes a esse genero. Atualmente o genero Acinetobacter compreende 33 especies descritas e mais 28 grupos genomicos aguardando uma posicao taxonomica definitiva em relacao a sua nomenclatura. Dentre essas especies destacam-se o complexo A. calcoaceticus-baumannii devido a sua importancia clinica, principalmente aquela que e um dos mais importantes patogenos da atualidade, A. baumannii. Devido a fenotipo de multirresistencia apresentado pelos isolados de A. baumannii, os carbapenens sao uma das poucas opcoes no limitado arsenal terapeutico para o tratamento de infeccoes causadas por esses micro-organismos. Entretanto, surtos causados por cepas de A. baumannii resistentes aos carbapenens tem se tornado um problema mundial. A erradicacao das cepas de A. baumannii no ambiente hospitalar e dificil, pois uma vez que clones multirresistentes se estabelecem nesse nicho, eles se tornam endemicos. Dentre os mecanismos de resistencia aos carbapenens em A. baumannii, somente a producao de β-lactamases tem sido estudada com maior frequencia. Embora se saiba que o principal grupo de carbapenemases produzidas por isolados de A. baumannii seja o grupo das oxacilinases, que hidrolisam fracamente os carbapenens, esse fato reforca a hipotese de que outros mecanismos poderiam estar contribuindo nesse fenotipo. Sendo assim, o artigos aqui apresentados buscaram avaliar a dinamica da resistencia aos β-lactamicos em amostras clinicas de Acinetobacter spp. isoladas no Brasil e na Espanha. Artigo cientifico 1: Ainda e limitada as informacoes sobre o papel das proteinas ligadoras de penicilina (PBPs) na resistencia aos b-lactamicos em Acinetobacter baumannii. Este estudo teve como objetivo determinar as sequencias de nucleotideos dos genes que codificam as PBPs em A. baumannii e analisar as variacoes alelicas nesses genes em isolados sensiveis ou resistentes aos b-lactamicos. Sete genes de PBPs e um gene codificador de uma transglicosilase monofuncional (MGT) foram identificadas nos seis genomas de A. baumannii sequenciados, codificadores de (i) quatro proteinas de alto peso molecular (dois da classe A, PBP1a [ponA] e PBP1b [mrcB], e duas PBPs de classe B, PBP2 [pbpA/mrdA] e PBP3 [ftsI]), (ii) tres PBPs de baixo peso molecular (sendo duas do Tipo-5, PBP5/6 [dacC] e PBP6b [dacD], e uma PBP do Tipo-7 (PBP7/8 [pbpG]), e (iii) uma enzima monofuncional (MtgA [mtgA]). Regioes de grandes variacoes foram observadas, embora a maior parte das alteracoes alelicas encontradas foram traduzidas em mutacoes silenciosas. As sequencias de aminoacidos dos genes das PBPs nos genomas e nos isolados clinicos apresentaram ser altamente conservadas. As mutacoes encontradas nas sequencias de aminoacidos estavam mais associadas aos perfis clonais, do que diretamente relacionadas sensibilidade ou resistencia aos b-lactamicos. Artigo cientifico 2: Uma cepa de A. pittii resistente aos carbapenems carreando um nova variante do cluster OXA-24 foi isolada em Santander, localizada no norte da Espanha em 2008. O isolado tambem apresentava altos niveis de resistencia a penicilina e aos monobactamicos, e era sensivel as cefalosporinas de amplo espectro. A analise da sequencia de nucleotideos confirmou a presenca do gene blaOXA-207 codificador de uma nova carbapenemase, que apresenta uma mutacao pontual Gly222Val em relacao a OXA-24. Clonagem e analise da cinetica enzimatica mostrou que a OXA-207 apresenta uma reducao na efiCiência catalitica contra carbapenems, mas aumentou consideravelmente a especificidade para a oxacilina comparada com OXA-24, de acordo com os dados anteriores da funcao estrutural dessa. Artigo cientifico 3: Oitenta e seis isolados clinicos identificados pelo sistema MicroScan-WalkAway ® como complexo A. calcoaceticus-baumannii e coletados durante o periodo 2004-2008 em um hospital universitario e terciario, teve sua identificacao confirmada por ARDRA. Apenas 44,2% dos isolados foram confirmados como sendo A. baumannii carreando 12 tipos diferentes de gene blaOXA-51-like. Foram tambem xxiii identificados oito diferentes especies nao-baumannii, sendo A. pittii (41,8%) a especie mais frequente. Todos os isolados de A. baumannii resistentes aos carbapenens carreavam os genes blaOXA-24/40 ou blaOXA-51 associado a ISAba1. O gene blaOXA-58 foi encontrado em 19 dos 24 isolados de A. pittii pertencentes a um clone sensivel aos carbapenems. Especies emergentes de Acinetobacter foram identificadas em nosso hospital e sua incidencia real pode ser subestimada pela identificacao apenas por meio de sistemas automatizados. Artigo cientifico 4: Acinetobacter junii e um patogeno humano raro associado a bacteremia em recem-nascidos e pacientes de unidade de oncologia pediatrica. Apresentamos um caso de A. junii causando bacteremia em um paciente adulto transplantado com leucemia. A correta identificacao de especies de Acinetobacter pode esclarecer o real significado clinico das diferentes especies deste genero. Artigo cientifico 5: Uma alta prevalencia de blaOXA-23 e uma baixa prevalencia de blaOXA-143 foi encontrada entre os isolados de A. baumannii em hospitais privados brasileiros. A prevalencia das CHDLs pode variar de acordo com o clone disseminado em um hospital ou em uma regiao geografica especifica e realcam a importancia da aderencia adequada as medidas de controle de infeccao hospitalar. Assim, estudos de vigilancia nacionais sao necessarios para analisar a prevalencia real da CHDLs nos hospitais brasileiros. Artigo cientifico 6: O objetivo deste estudo foi avaliar a dinamica temporal de carbapenemases em uma colecao de isolados de Acinetobacter spp coletados durante um periodo de 18 anos em um hospital brasileiro. Um total de 215 isolados apresentando altas taxas de resistencia aos carbapenenens foi analisado no periodo de 1993 a 2010. A. baumannii foi responsavel por 96,3% dos isolados. O gene blaOXA- 23 foi detectada em 36,7% (79/215) das amostras, seguido por blaOXA-143 (n=49, 22,7%), blaIMP-1 (n=24, 11,2%), blaIMP-10 (n=3, 1,4%) e blaOXA-72 (n=2, 0,9%). O primeiro isolado de A. baumannii carreando gene blaOXA-143 foi identificado em 1995, sete anos antes da Introdução do clone de A. baumannii produtor de OXA-23 em 2002. Nos descrevemos pela primeira vez, a presenca de IMP-1 em A. pittii e A. bereziniae, e a OXA-58 em A. genomic species Close to 13TU. A OXA- 143 demonstrou ser uma enzima antiga em nosso hospital. A dinamica da producao carbapenemase e complexa e varia drasticamente em funcao do tempo. Artigo cientifico 7: Este estudo relata a ocorrencia da OXA-231, uma nova variante do cluster OXA-143, em uma cepa clinica de A. baumannii resistente aos carbapenens isolada em um hospital de terciario universitario localizado no Sul do Brasil
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    Resistance trends of Acinetobacter spp. in Latin America and characterization of international dissemination of multi-drug resistant strains: five-year report of the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program
    (Elsevier B.V., 2004-09-01) Tognim, Maria Cristina Bronharo [UNIFESP]; Andrade, Soraya Sgambatti [UNIFESP]; Silbert, Suzane [UNIFESP]; Gales, Ana Cristina [UNIFESP]; Jones, Ronald N.; Sader, Helio Silva [UNIFESP]; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP); Universidade Estadual de Maringá (UEM); Jones Grp
    Objectives: To analyze the antimicrobial susceptibility of Acinetobacter spp. isolates collected from Latin American medical centers as part of the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program and also to evaluate the dissemination of mutti-drug resistant Acinetobacter spp. strains in the region.Methods: A total of 826 isolates of Acinetobacter spp. from multiple infection sites were collected from January 1997 to December 2001 in ten medical centers and susceptibility tested to >25 selected agents by broth microdilution. Multi-drug resistant Acinetobacter spp. isolates were molecular typed.Results: Resistance rates to carbapenems varied significantly among countries. A continued annual increase occurred in the Argentinean medical centers. in contrast, carbapenem resistance was rare in Chilean centers, and decreased significantly in the Brazilian institutions. Acinetobacter spp. isolates recovered from lower respiratory tract and bloodstream infections were associated with lower antimicrobial susceptibility rates. Resistance rates to imipenem were higher among isolates collected from intensive care units (13.5%) than among isolates from other units. A major ribogroup pattern (521-1) was detected among eight Acinetobocter spp. strains isolated from three distinct Latin American countries.Conclusions: This study found that antimicrobial resistance is still a major issue among Acinetobacter spp. isolates collected from some Latin American countries. the dissemination of a major bacterial cluster in different regions reinforces the importance of longitudinal surveillance programs, such as SENTRY, as valuable tools for monitoring antimicrobial susceptibility rates and guiding local interventions. (C) 2004 International Society for Infectious Diseases. Published by Elsevier B.V. All rights reserved.
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    Uso parenteral de polimixinas no tratamento de infeccoes por bacilos gram-negativos multirresistentes
    (Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 2006) Lima, Dorival Duarte [UNIFESP]
    Objetivos: Analisar as caracteristicas clinicas e epidemiologicas, a resposta clinica, e os efeitos colaterais envolvidos no tratamento com polimixinas parenterais nas infeccoes por Pseudomonas aeruginosa e Acinetobacter baumannii; e avaliar, nos pacientes com infeccao da corrente sanguinea, o potencial impacto em sua sobrevida, determinado pelo tempo transcorrido entre a coleta das hemoculturas e o inicio das polimixinas. Metodos: Estudo retrospectivo descritivo do uso das polimixinas, no periodo de janeiro de 2001 a dezembro de 2003. De 361 pacientes que receberam polimixinas, elegeram-se 92 com isolamento de P. aeruginosa e Acinetobacter spp. presuntivamente em sangue, liquido pleural e liquido cefalorraquideo, e seus prontuarios foram avaliados. Resultados: Em 73 pacientes, isolou-se um bacilo Gram-negativo em hemoculturas (52 Pseudomonas aeruginosa, 12 Acinetobacterspp., 2 Klebsiella pneumoniae, 2 Stenotrophomonas maltophilia, e 5 outros bacilos Gram-negativos). As doencas de base mais comuns foram as neoplasicas, infecciosas, neurologicas e trauma. Sessenta e nove (70,5 por cento) tiveram hospitalizacao previa em UTI e o periodo medio de hospitalizacao previo a infeccao foi de 38 dias. Vinte e cinco (27,2 por cento) tiveram bacteremias por outros microorganismos nos 15 dias precedentes, e 15 (16,3 por cento) nos 15 dias subsequentes ao inicio das polimixinas. Quinze (16,3 por cento) dos 92 pacientes tiveram bacteremia polimicrobiana, 80 por cento dos quais faleceram. Oitenta e sete (94,6 por cento) receberam antimicrobianos previo as polimixinas, principalmente vancomicina (em 79,3 por cento) e carbapenemas (em 71,7 por cento). Oitenta e seis por cento das Pseudomonas aeruginosa eram resistentes a imipenem. Os indices de resistencia de Acinetobacter spp. as cefalosporinas, amicacina e ciprofloxacina foram maiores de 80 por cento. As polimixinas foram iniciadas antes de 24 horas desde a coleta das hemoculturas em 7,6 por cento, e em 72 horas em 62,1 por cento dos pacientes. A letalidade em 14 dias para as bacteremias por Pseudomonas aeruginosa foi de 54,5 por cento e para Acinetobacter spp. de 50,0 por cento. Oitenta e tres (90,2 por cento) receberam polimixina B e 9 (9,8 por cento) colistina, com duracao media de 14 dias. A mortalidade tendeu a ocorrer quando tardava mais de 24 horas para iniciar-se as polimixinas, ainda que sem significancia estatistica (p=0,250). Dois (2,2 por cento) pacientes tiveram efeitos secundarios neurologicos, 11 (18,3 por cento) de 60 pacientes com funcao renal normal tiveram insufiCiência renal e 2 deles requereram hemodialise. A insufiCiência renal piorou em 12 (41,4 por cento) de 29 pacientes com alteracao renal pre¬polimixinas, 5 dos quais necessitaram hemodialise. Todos os pacientes que requereram hemodialise haviam recebido aminoglicosideos, vancomicina ou anfotericina B concomitantes as polimixinas. Conclusoes: A letalidade das bacteremias por Pseudomonas aeruginosa foi maior que por Acinetobacter spp., e tendeu a ocorrer quando tardou-se mais de 24 horas para iniciar-se as polimixinas, sendo elevadissima nas bacteremias polimicrobianas. A toxicidade neurologica e renal das polimixinas foi semelhante ou menor que em outros estudos previos. Aminoglicosideos, vancomicina e anfotericina B contribuem para a insufiCiência renal quando utilizados conjuntamente com as polimixinas, pelo que devem ser evitados. No Hospital São Paulo e outros nosocomios com perfil epidemiologico semelhante, pacientes e com hospitalizacao prolongada, permanencia em UTI, antibioticoterapia de amplo espectro recente especialmente envolvendo carbapenens, em vigencia de bacteremia devem inicialmente incluir as polimixinas na antibioticoterapia empirica