Evidências de recombinação entre variantes SARS-CoV-2 através da análise de sequencias somente brasileiras
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Data
2023-12-21
Autores
Bueno, Marcelo [UNIFESP]
Orientadores
Briones, Marcelo Ribeiro da Silva [UNIFESP]
Tipo
Trabalho de conclusão de curso de graduação
Título da Revista
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Resumo
A recombinação viral é um processo genético em que o material genético de duas linhagens diferentes é trocado, levando assim à formação de novas variantes genéticas. Tal ocorrência é mais comum nos vírus de RNA, como o SARS-CoV-2 causador da COVID-19. O processo de recombinação pode ocorrer quando o organismo hospedeiro é infectado por duas variantes diferentes. Durante a replicação, os segmentos de RNA podem ser trocados, resultando em uma combinação de material genético de ambas as cepas, podendo levar à formação de um novo vírus com características genéticas diferentes das cepas parentais originais. Desta forma o que se observa é o fato de que a recombinação viral é uma das causas da rápida evolução dos vírus levando a adquirir novas características, tais como: resistência a medicamentos antivirais; evasão do sistema imunológico; mudanças nas propriedades de transmissão. Vale destacar que, o vírus SARS-CoV-2 vem sofrendo mutações ao longo do tempo, o que levou à formação de novas variantes, sendo a recombinação genética, onde o material genético é trocado entre diferentes cepas do vírus, é um dos mecanismos pelos quais novas variantes podem surgir. Tal Mecanismo inclusive, pode tornar insuficiente a análise evolutiva do SARS-CoV-2 apenas por filogenia, de modo que outras técnicas, tal como PCA, explicam melhor a variação observada nas linhagens virais atuais. Embora a recombinação viral seja um acontecimento comum em vírus de RNA, nem todos os vírus passam por esse processo com a mesma frequência, além disso, nem toda recombinação resultara em variantes viáveis ou que venham a ter um impacto significativo na dinâmica de infecção e ou reinfecção do hospedeiro. Portanto, compreender os eventos de recombinação e rastrear eventos de alterações dos genes auxilia a compreender o comportamento de evolução e infecção deste vírus.
Viral recombination is a genetic process in which the genetic material of two different strains is exchanged, thus leading to the formation of new genetic variants. This is most common in RNA viruses, such as SARS-CoV-2, which causes COVID-19. The recombination process can occur when the host organism is infected with two different variants. During replication, RNA segments can be exchanged, resulting in a combination of genetic material from both strains, which can lead to the formation of a new virus with different genetic characteristics from the original parental strains. Thus, viral recombination is one of the causes of the rapid evolution of viruses, leading them to acquire new characteristics, such as: resistance to antiviral drugs; evasion of the immune system; changes in transmission properties. It is worth noting that the SARS-CoV-2 virus has mutated over time, which has led to the formation of new variants, and genetic recombination, where genetic material is exchanged between different strains of the virus, is one of the mechanisms by which new variants can arise. This mechanism may even make the evolutionary analysis of SARS-CoV-2 by phylogeny alone insufficient, so that other techniques, such as PCA, better explain the variation observed in current viral lineages. Although viral recombination is a common event in RNA viruses, not all viruses go through this process with the same frequency, and not all recombination will result in viable variants or variants that will have a significant impact on the dynamics of infection and/or reinfection of the host. Therefore, understanding recombination events and tracking gene alteration events helps to understand the evolution and infection behavior of this virus.
Viral recombination is a genetic process in which the genetic material of two different strains is exchanged, thus leading to the formation of new genetic variants. This is most common in RNA viruses, such as SARS-CoV-2, which causes COVID-19. The recombination process can occur when the host organism is infected with two different variants. During replication, RNA segments can be exchanged, resulting in a combination of genetic material from both strains, which can lead to the formation of a new virus with different genetic characteristics from the original parental strains. Thus, viral recombination is one of the causes of the rapid evolution of viruses, leading them to acquire new characteristics, such as: resistance to antiviral drugs; evasion of the immune system; changes in transmission properties. It is worth noting that the SARS-CoV-2 virus has mutated over time, which has led to the formation of new variants, and genetic recombination, where genetic material is exchanged between different strains of the virus, is one of the mechanisms by which new variants can arise. This mechanism may even make the evolutionary analysis of SARS-CoV-2 by phylogeny alone insufficient, so that other techniques, such as PCA, better explain the variation observed in current viral lineages. Although viral recombination is a common event in RNA viruses, not all viruses go through this process with the same frequency, and not all recombination will result in viable variants or variants that will have a significant impact on the dynamics of infection and/or reinfection of the host. Therefore, understanding recombination events and tracking gene alteration events helps to understand the evolution and infection behavior of this virus.
Descrição
Citação
BUENO, Marcelo. Evidências de recombinação entre variantes sars-cov-2 através da análise de sequencias somente brasileiras. 2023. 33 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Informática Aplicada à Saúde) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo, 2023.