Navegando por Palavras-chave "Hipermetilação"

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    Acesso aberto (Open Access)
    Avaliação genética e epigenética de genes de reparo de DNA em pacientes com rearranjos cromossômicos complexos
    (Universidade Federal de São Paulo, 2024-12-09) Oliveira, Juliana Valério de [UNIFESP]; Melaragno, Maria Isabel [UNIFESP]; Aissa, Alexandre Ferro; http://lattes.cnpq.br/7018576368864014; http://lattes.cnpq.br/0678071850781758; http://lattes.cnpq.br/5543030015031220
    Os rearranjos cromossômicos resultam de uma reconstituição anormal de cromossomos que sofreram quebras no DNA. Esses rearranjos podem ser complexos quando envolvem múltiplas quebras e reorganização cromossômica, podendo incluir deleções, inversões, duplicações, translocações, entre outras alterações estruturais dos cromossomos. Vários mecanismos de formação de rearranjos complexos já foram descritos, como recombinação homóloga não alélica (NAHR), junção de extremidades não homólogas (NHEJ), entre outros, mas pouco se sabe sobre a influência de mecanismos epigenéticos. A epigenética é caracterizada por alterações moleculares herdáveis que regulam a expressão gênica sem alterar a sequência do DNA. Um dos mecanismos epigenéticos mais importantes é a metilação do DNA, que é responsável por regular diretamente a maioria dos genes em todo o genoma. Esse mecanismo pode influenciar processos biológicos por meio da regulação do estado de metilação das ilhas CpGs que estão presentes na região reguladora de diversos genes. A hipótese deste projeto é que pacientes com rearranjos cromossômicos germinativos complexos podem apresentar alterações no DNA ou alterações epigenéticas nas regiões promotoras em genes relacionados ao reparo de DNA. Para investigar essas hipóteses, avaliamos a presença de variantes de nucleotídeo único (SNVs) e de variantes de número de cópias (CNVs) em genes de reparo estudados e também comparamos a metilação das ilhas CpG nas regiões promotoras desses genes entre os pacientes e um grupo controle saudável. Os pacientes selecionados já possuíam, pelo menos parcialmente, a caracterização de seus rearranjos cromossômicos complexos. A partir de amostras de sangue periférico, utilizamos a técnica de Long-Read Sequencing (LRS) da plataforma PacBio para gerar um vasto conjunto de dados, que foram analisados por meio de ferramentas de bioinformática. Os resultados indicam que, em comparação com o grupo controle saudável, os pacientes apresentam hipermetilação nas regiões promotoras de alguns genes de reparo de DNA, embora nem todos os genes analisados apresentem alterações em todos os pacientes. Esses dados sugerem que pode haver uma associação entre o aumento da metilação da região promotora de genes de reparo de quebra de fita dupla e rearranjos cromossômicos complexos.