Navegando por Palavras-chave "Genética microbiana"

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    Análise microbiológica de isolados de Pseudomonas spp. provenientes das cinco regiões geográficas brasileiras sob uma perspectiva de saúde única
    (Universidade Federal de São Paulo, 2024-11-29) Neves, Raíssa Fidelis Baêta [UNIFESP]; Da Silva, Rodrigo Cayô [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/5699739668358897; http://lattes.cnpq.br/7281383255204440
    A relevância dos genes de resistência aos antimicrobianos (ARGs) mediados por elementos genéticos móveis (MGE) não se restringe à sua presença em patógenos clínicos, mas envolve todas as bactérias, sejam elas patogênicas, comensais ou ambientais, capazes de atuar como reservatório desses genes. Devido à sua versatilidade metabólica e capacidade de colonizar diversos ambientes, Pseudomonas se destaca como um gênero bacteriano de grande interesse, relevante no contexto clínico, ambiental e biotecnológico. O presente estudo teve por objetivo identificar, analisar e caracterizar cepas de Pseudomonas spp. isoladas em diferentes matrizes ambientais nas cinco regiões geográficas brasileiras, sob os preceitos de saúde única, investigando o resistoma bacteriano. Um total de 462 isolados de Pseudomonas spp. foram recuperados de amostras de solo, água e fezes (humanas e animais) coletadas pelos centros participantes do Grupo GUARANI. Os isolados foram cultivados em meio cromogênico após incubação em meio de cultura líquido suplementado com ceftriaxona, ceftazidima e meropeném (2 µg/mL cada), acrescidos de vancomicina (4 µg/mL). A identificação bacteriana foi realizada por espectrometria de massa, seguida por testes de sensibilidade pelo método de diluição em ágar (BrCAST/EUCAST) utilizando os mesmos antimicrobianos da seleção inicial. Foi realizada a triagem molecular de ARGs para β-lactâmicos, aminoglicosídeos e fluoroquinolonas pela técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR). Os ARGs detectados foram confirmados por sequenciamento de Sanger e a análise clonal foi realizada por ERIC-PCR. Os isolados carreadores de ARGs com resultados confirmados pelo sequenciamento de Sanger tiveram as CIMs determinadas pela técnica de diluição em ágar para os principais antimicrobianos de importância clínica. A sensibilidade à piperacilina/tazobactam foi determinada pelo método de disco-difusão. Os isolados recuperados estavam distribuídos entre as matrizes da seguinte forma: fezes de suínos (n=138), fezes humanas (n=98), solo (n=72), fezes de frango (n=60), água (n=45) e fezes de bovinos (n=45). As cidades de Ji-Paraná (n=137) e Fortaleza (n=115) forneceram o maior número de isolados, seguidos por Blumenau (n=94), Bragança Paulista (n=60), Castanhal (n=28) e Dourados (n=28). As espécies predominantes foram P. aeruginosa (43%) e P. putida (16%). Um total de 14 diferentes ARGs foram detectados em 92 isolados (19,9%). Estes incluíram blaCTX-M-1/2-like (n=3), blaKPC-like (n=11), blaBIC-like (n=2), blaBKC-like (n=7), blaOXA-1-like (n=1), blaOXA-23-like (n=3), blaOXA-24/40-like (n=1), blaOXA-46-like (n=8) e blaGIM-like (n=9) entre os ARGs para β-lactâmicos; aac(6')-Ib-cr (n=4), crpP (n=41) e qnrD (n=5) para resistência às fluoroquinolonas; e aac(6')-Ib (n=7) e rmtE (n=4) para aminoglicosídeos. Alguns dos ARGs detectados estavam restritos a algumas localidades, tais como blaCTX-M-1/2-like em Bragança Paulista e blaBIC-like em Blumenau, enquanto outros foram encontrados em mais de uma localidade, como foi o caso de blaGIM-like e qnrD (Ji-Paraná e Fortaleza), rmtE (Blumenau e Ji-Paraná), blaBKC-like (Blumenau e Fortaleza) e blaKPC-like (Castanhal, Blumenau, Fortaleza e Ji-Paraná). A análise clonal revelou poucos isolados relacionados, geralmente originários da mesma amostra submetida a diferentes pressões seletivas. A fase final dos testes de sensibilidade ficou prejudicada em decorrência da perda dos ARGs detectados por PCR e confirmados por sequenciamento de Sanger em muitos isolados. Ainda assim, o estudo revelou uma diversidade de ARGs em diferentes matrizes e regiões do Brasil, incluindo genes ainda não descritos em isolados de Pseudomonas spp. no país, reforçando seu papel como reservatórios de resistência. O estado do Ceará se destacou pela grande diversidade de ARGs encontrados e confirmados por sequenciamento. Além disso, apesar da alta frequência do gene crpP verificada na maioria das regiões brasileiras, o fenótipo de resistência obtido corrobora com os estudos que sugerem que a proteína CrpP não é capaz de reduzir a sensibilidade às fluoroquinolonas nas espécies de Pseudomonas. O estudo destaca o papel crucial dos plasmídeos na disseminação da RAM, reforçando a necessidade de investigações sobre sua propagação sob uma ótica capaz de integrar a saúde humana, animal e ambiental.