Navegando por Palavras-chave "Dinâmica Molecular"

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    Efeito de mistura e concentração iônica no desempenho de eletrólitos em supercapacitores
    (Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 2020-03-31) Inoue, Pedro Naoiti [UNIFESP]; Fileti, Thaciana Valentina Malaspina [UNIFESP]; Universidade Federal de São Paulo
    In this work, we performed an atomistic computational investigation of a different electrolyte’s class, which consists in the mixture of WiSE electrolytes (water-in-salt) with the organic liquid of acetonitrile, abbreviated by AWiSE. The WiSE-type electrolytes are the usual electrolytes of water + ions (cations and anions) in which the ion concentration is significantly higher (10 times higher). The addition of co-solvents (acetonitrile) to the electrolyte has been suggested to control and improve the physical properties, especially the electrolytic ones, of the WiSE electrolyte. Based on experimental studies, where mixtures of acetonitrile and water were investigated, here we investigate by means of the Molecular Dynamics technique not only the properties of pure electrolytes, but also of graphene electrolytic cells. For this, we consider the conventional Li-TFSI electrolyte in water in two different concentrations, 2 mol/L called ‘NORMAL’ and 21 mol/L labelled ‘WiSE’. To these two concentrations we add acetonitrile in three different concentrations: 3, 5, and 7 mol/L. For the study of supercapacitors, selected electrolytic cells were subjected to a potential difference of 0.0, 0.5, 1.0, 1.5, 2.0, 2.5 and 3.0V. Due this it was possible to investigate the performance of the proposed electrolyte solutions and quantify the effects of the mixture and concentration.
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    Encontros E Desencontros Entre O Sus E O Sinase: A Discricionariedade Nos Atendimentos Em Saúde Mental
    (Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 2017-05-05) Ferreira, Ildo Dos Santos [UNIFESP]; Paula, Liana De [UNIFESP]; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
    Ssues Related To Public Policies (Such As Their Mistakes And Correctness) Are Not Solved Simply By Implementing New Guidelines, Ordinances Or Changes In Laws. Often, Changes In Legislation, Which May Arise From A Social Demand Or From Different Political Projects, Depend On The People At The Top Of The System To Be Effective. These People, Public Servants (Who Can Be Bankrupt, Hired Or Commissioned), Put Laws And Systems In Place And Have Direct Contact With The Population. Servers That Attend At The Tip Of The System Have The Power To Choose How, When And Where Articles, Paragraphs And Legal Decrees Will Work. That Is, Both In The Public Health System And In What Regulates The Socio-Educational Attendance For Adolescents In Conflict With The Law, It Is Necessary To Act The Servants Who Work In These Areas So That The Laws Leave The Paper And Reach The People Who Are Taken Care Of.
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    Estudo computacional de sal de sódio como eletrólitos para sistemas de armazenamento de energia elétrica
    (Universidade Federal de São Paulo, 2023-05-23) Silva, Sabrina Santos Siqueira [UNIFESP]; Siqueira, Leonardo José Amaral de [UNIFESP]; Pereira, Guilherme Ferreira Lemos; http://lattes.cnpq.br/4334197942669791
    A segurança energética é um tema crucial para a segurança econômica de um país, sendo as baterias uma das peças fundamentais para a garantia desta estabilidade. Atualmente a bateria de íon lítio possui algumas limitações para a sua utilização em massa, sendo as baterias de íon sódio uma proposta promissora para sua substituição. Uma parte importante da bateria é o eletrólito, pois ele é responsável pela condução da corrente elétrica gerada, sendo os líquidos iônios grandes promissores para serem utilizados como eletrólitos, pelas suas características, como a viscosidade e a condutividade iônica, que são intimamente ligadas a capacitância especifica. Portanto, neste trabalho estudamos as propriedades estruturais e de transporte do líquido iônico Sódio-bis(tri-fluoro-metano)sulfonil)imida em meio aquoso, que é um possível eletrólito para baterias de íon sódio. Esse estudo verificou os comportamentos estruturais através da distribuição radial e número de coordenação e as propriedades de transporte pelo deslocamento quadrático médio, demonstrando uma interatividade do ânion com o cátion.
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    Estudo computacional por dinâmica molecular do flavonóide Sakuranetina na interface água-lipídio
    (Universidade Federal de São Paulo, 2021-12-14) Freire, Vitor Torres [UNIFESP]; Siqueira, Leonardo José Amaral de [UNIFESP]; Pereira, Rafael Guimarães [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/4334197942669791
    Nos últimos anos, com o aumento de microrganismos resistentes aos antibióticos tradicionais e com o aumento do índice de doenças cardiovasculares, respiratórias e carcinomas na população é necessário cada vez mais compreender o mecanismo de ação de compostos de origem natural que possam ajudar a enfrentar esses novos desafios. A sakuranetina (SAK), um flavonóide encontrado em diversos vegetais, apresenta capacidade anti-inflamatória, antiprotozoária, antiviral, antitumoral e antimicrobiana, porém, seu mecanismo de interação com células ainda não é bem estabelecido na literatura. Simulações computacionais por Dinâmica Molecular em modelos simplificados de membrana celular são uma ferramenta viável, de baixo custo e bem fundamentada na literatura para ajudar a compreender esses fenômenos. Neste trabalho uma molécula de sakuranetina foi disposta no vácuo e empurrada através de uma monocamada de dipalmitoilfosfatidilcolina (DPPC), um fosfolipídio comum em membranas biológicas, até uma fase aquosa, simulando uma membrana biológica. Medidas físico-químicas e termodinâmicas foram tomadas nesse processo. Verificou-se que o custo energético para que a sakuranetina realize esse processo é de aproximadamente 150 kJ/mol, relativamente mais alto do que de outras substâncias; que a posição energeticamente mais favorável nesse trajeto é próximo do fim das cadeias apolares do DDPC e que uma vez nessa posição ela assume configurações espaciais específicas, interagindo de forma diferente com os elementos do sistema e expandindo o filme da monocamada, aumento em até 4,2% a área ocupada por molécula de lipídio. O estudo, portanto, permitiu um detalhamento de como se dá o processo de interação deste flavonóide com membranas biológicas.
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    Interação Entre Peptídeos Com Propriedades Antibacterianas E Membranas Lipídicas:Investigação Por Modelagem Computacional
    (Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 2017-02-24) Outi, Felipe De Oliveira [UNIFESP]; Fileti, Eudes Eterno [UNIFESP]; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
    The antibacterial activity of amphiphilic peptides of the AnK type has been studied, which the letter n represents the alanine residue sequence. Such studies have shown that increasing the length of the polyalanine tail is related to the increase in the bactericidal power of the peptide, that is, A3K showing quite weak bactericidal activity whereas A9K shows the highest activity. In this work we propose the computational investigation of the interaction of AnK peptides (with n = 3, 6, and 9) in contact with two different types of lipid, DPPC and DPPG, representing mammals and bacterial membranes, respectively. The hypothesis to be investigated here is that the polyalanine tail length is directly proportional to the bactericidal power of the peptides. To access relevant information on the interaction between peptide and membrane, molecular dynamics simulations and techniques to calculate the potential of mean force were used to evaluate the energetic, dynamic, structural and thermodynamic properties. Our results elucidate, at the molecular level, the important details of the interaction between the peptides and the biological membrane, and provide a quantitative description of the energy and thermodynamics of the systems investigated. This description discards the hypothesis that the size of the polyalanine tail of the peptide is directly responsible for cell death. In addition, we observed that the simplified infinite dilution model, where a single peptide interacts with the biological membrane, was not sufficient to describe the membrane rupture process, and considerations involving peptide concentration, peptide nanostructures morphology, pH of the solutions, among other physical-chemical factors, should be taken into account.
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    Simulação de materiais com propriedades metálicas em eletrólitos
    (Universidade Federal de São Paulo, 2022-11-24) Silva, Isabel Amaral da [UNIFESP]; Siqueira, Leonardo José Amaral de [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/4334197942669791; http://lattes.cnpq.br/4160745506966267
    Nas últimas décadas, o interesse por soluções mais sustentáveis de produção de energia tem aumentado, principalmente, visando soluções para controlar e diminuir os efeitos crescentes do aquecimento global antropogênico. Tal fato só reforçou a necessidade de armazenar energia para uso posterior. Entre os dispositivos de armazenamento de energia mais conhecidos e utilizados atualmente estão as baterias e/ou supercapacitores. Nesse contexto, eletrólitos aquosos superconcentrados (“Water-in-Salt Electrolyte”- WiSE) são uma solução alternativa eficiente, segura e ecologicamente mais correta para substituir eletrólitos de solventes orgânicos em dispositivos de armazenamento de energia. Ao se aumentar a concentração de sal em um eletrólito aquoso, a janela de estabilidade eletroquímica da solução superconcentrada aumenta em relação a eletrólitos aquosos pouco concentrados. Desta forma, os WiSE são considerados bons candidatos a eletrólitos para supercapacitores e podem ser combinados com diferentes tipos de eletrodos, por exemplo, carbetos de metais de transição com estruturas bidimensionais (2D), conhecidos como MXenes, que possuem excelente desempenho em termos de capacitância, quando utiliza dos como eletrodos. Nesta dissertação, apresentamos um estudo computacional detalhado de WiSEs confinados em eletrodos Ti3C2F2 planares e porosos, empregando simulações de dinâmica molecular (DM) com uma extensão do modelo de potencial constante (CPMχ) que considera as diferentes eletronegatividades para eletrodos heterogêneos. No caso dos eletrodos planares, realizamos uma comparação detalhada e quantitativa entre as propriedades calculadas para Ti3C2F2 e eletrodos de grafite usando técnicas de aprendizado não supervisionado para análise de dados. A análise mostrou que independentemente do WiSE e do tipo de eletrodo, os cátions carregam suas esferas de solvatação quando são atraídos pelo eletrodo negativo ou repelidos pelo eletrodo positivo e o comportamento das moléculas de água dentro das camadas mais próximas do eletrodo parece ser mais sensível à natureza química do eletrodo. Nos eletrodos porosos de Ti3C2F2 com fenda de 12,6 Å, o eletrólito NaClO4 proporciona maior acúmulo de carga que os demais WiSEs. Além disso, o mecanismo de carregamento dos eletrodos porosos com WiSEs de sódio muda completamente durante a simulação passando de um mecanismo inicial de adsorção de contra-íons para um mecanismo de dessorção de coíons em tempos mais longos.
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    Simulações Computacionais De Sistemas Absorvedores De Gases
    (Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 2017-08-28) Cardoso, Piercarlo Fortunato [UNIFESP]; Siqueira, Leonardo Jose Amaral De [UNIFESP]; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
    n this work, molecular dynamics simulations were employed in order to obtain physicochemical properties of solvation of the H2S, CO2 and CH4 gases in the ionic liquid butyltrimethylammonium bis(trifluoromethylsulfonyl)imide (IL), in the polymer poly (oxyethylene) (PEO) and in the mixing of the ionic liquid with the polymer. From the values of free energy of solvation (ΔGsol) of the gases in the three different systems were estimated the values of Henry's Law constant (KH) for CO2, H2S and CH4. Regardless the absorption system, the solubility of H2S was always greater than that of CO2, which in turn was more soluble than CH4. Among the systems, PEO showed the greatest solubility and interaction with the gases. In the study of bulk dynamic properties, the gas diffusion coefficients (D) were higher in the system with lower gas-absorber interactions. From the diffusion coefficients and of solubilities, the permeabilities of the gases in the systems were estimated. The H2S gas has been shown to be the most permeable in all three systems, while CH4 is the least permeable. For the study of the interface properties, it was observed by the density profiles that H2S has higher density inside the liquid phase. The existence of peaks in the density profiles at the liquid-gas interfaces evidences the adsorption layer of the gases. Potentials of mean force calculated from the density profiles showed the existence of valleys at the liquid-gas interfaces, whose depths followed the order: H2S > CO2 > CH4. The depth of the valleys presented correlation with the residence time of the gas at the surface of the liquid, that is, the deeper the valley, the longer the residence time of the gas at the interface. It was also observed a correlation between the residence time at the interface with the rate of absorbed gas molecules by the system. Therefore, the residence time and absorption kinetics of the molecules follow the order: H2S > CO2 > CH4. In the comparison between the systems, the PEO was the system that presented the highest solubility and highest rates of gas absorption.