Análise da variação no número de cópias (CNV) de DNA em uma família com síndrome NEM 2A e mutação p.G533C no gene RET: identificação de regiões associadas à predisposição para o desenvolvimento de metástase aos linfonodos
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Data
2013
Autores
Araujo, Aline Neves [UNIFESP]
Orientadores
Cerutti, Janete Maria [UNIFESP]
Tipo
Dissertação de mestrado
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Resumo
O carcinoma medular da tiroide (CMT) e um tumor maligno originado das celulas C da tiroide, que pode ocorrer na forma hereditaria como parte da sindrome de neoplasia endocrina multipla do tipo 2 (NEM 2), ou na forma esporadica. A forma hereditaria e dividida nas variantes clinicas NEM 2A, NEM 2B e CMTF (carcinoma medular de tiroide familial). Nosso grupo identificou uma nova mutacao no gene RET (p.G533C) em uma familia com NEM 2A. Uma vez que a analise de seguimento dos pacientes indicou uma heterogeneidade clinica entre os portadores da mutacao, principalmente associada a presenca de metastase aos linfonodos, tivemos como objetivo principal investigar se a variacao no numero de copias (CNV) de DNA, presente na linhagem germinativa, poderia estar associada a predisposicao ao desenvolvimento de metastase aos linfonodos nesta familia, bem como correlacionar as CNVs candidatas as demais caracteristicas clinicas. Para isso, quinze pacientes com CMT e mutacao p.G533C foram divididos em dois grupos (com presenca de metastase aos linfonodos, n=8, e sem metastase, n=7) e utilizados em um screening inicial, pela hibridizacao individual de seus DNAs em chips da plataforma Genome-Wide Human SNP Array 6.0. A analise comparativa entre os grupos resultou na identificacao de dez regioes contendo CNVs que poderiam estar associadas a agressividade do CMT. As regioes candidatas, algumas delas contendo genes, foram avaliadas pela reacao em cadeia da polimerase quantitativa (qPCR) em um grupo maior de pacientes da familia (n=26), composto pelos individuos iniciais alem de mais membros da familia. A validacao dessas CNVs por qPCR identificou uma CNV associada ao fenotipo mais agressivo, observado pela presenca de metastase aos linfonodos na familia (Teste Exato de Fisher; 0,05), que foi a delecao de FMN2 (P=0,0362). As regioes alteradas tambem foram analisadas em conjunto, e o Teste Exato de Fisher revelou que as alteracoes (delecoes/amplificacoes) foram diferentes entre o grupo metastatico e nao metastatico (P=0,0310), sendo que as delecoes no grupo metastatico (P=0,0375) apresentaram-se como mais determinantes para diferenciar os grupos do que as amplificacoes no grupo nao metastatico (P=0,0873). Os dados sugerem que, em geral, as delecoes foram mais associadas ao pior curso clinico da doenca, como observado pela CNV de delecao que contem o gene FMN2 que foi relacionada a presenca de metastase aos linfonodos, assim como o agrupamento das regioes deletadas foi tambem relacionado a metastase. Em conclusao, nos definimos um perfil de CNVs relacionadas a presenca de metastase aos linfonodos em pacientes com CMT e mutacao p.G533C no gene RET
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ARAUJO, Aline Neves. Análise da variação no número de cópias (CNV) de DNA em uma família com síndrome NEM 2A e mutação p.G533C no gene RET: identificação de regiões associadas à predisposição para o desenvolvimento de metástase aos linfonodos. 2013. 94 f. Dissertação (Mestrado em Ciências) – Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo. São Paulo, 2013.