Caracterização de subtipos e de recombinantes intersubtipos do vírus da imunodeficiência humana(HIV-1) em amostras do município de São Paulo - SP
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Data
2003
Autores
Sa-Filho, Dercy Jose de [UNIFESP]
Orientadores
Diaz, Ricardo Sobhie [UNIFESP]
Tipo
Tese de doutorado
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Resumo
Objetivo: Caracterizacao de subtipos e recombinantes intersubtipos do HIV-1 em amostras do Municipio de São Paulo - SP. Analisar o genoma completo de amostras recombinantes B/F, objetivando a identificacao de uma possivel forma recombinante circulante (CRF) na populacao estudada. Casuistica e Metodos: Foi analisado um fragmento de 1.2Kb, correspondente das regioes da protease e da transcriptase reversa do gene pol do HIV-1 de 215 amostras de individuos em tratamento anti-retroviral. A identificacao dos subtipos foi realizada utilizando-se os metodos Neighbor Joining e Maximum Likelihood. As amostras identificadas como recombinantes foram avaliadas pelos metodos Bootscan e Splits Tree. As sequencias que demonstraram pontos similares de recombinacao foram selecionadas para a amplificacao e sequenciamento do genoma viral completo. Resultados: As analises filogeneticas do gene pol demonstraram uma maior frequencia do subtipo B do HIV-1 (87.9 por cento), seguido dos recombinantes B/F (8.4 por cento) e subtipo F (3.7 por cento). Foram selecionadas seis amostras que possuiam estruturas comuns de recombinacao no gene pol para amplificacao e sequenciamento do genoma completo do HIV-1. A analise do genoma completo revelou diferentes padroes de recombinacao ao longo do genoma viral. Observamos pela analise do genoma completo do HIV-1, uma frequencia maior de eventos de recombinacao nos genes gag-pol e um envelope viral majoritariamente do subtipo B. Conclusoes: Observamos pela analise do gene pol do HIV-1 uma maior frequencia de amostras recombinantes B/F em relacao ao subtipo F puroa(au)
Descrição
Citação
São Paulo: [s.n.], 2003. 83 p.