Navegando por Palavras-chave "Fusarium"
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- ItemAcesso aberto (Open Access)Avaliação do perfil de susceptibilidade de 157 amostras clinicas e ambientais de Fusarium spp. frente a 05 antifúngicos(Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 2008) Azevedo, Viviane Reis de [UNIFESP]; Colombo, Arnaldo Lopes [UNIFESP]; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)Introdução: Fusarium spp. representa um fitopatógeno de grande importância econômica no Brasil e no mundo. Nos seres humanos pode causar diversos tipos de doenças, que vão desde infecções superficiais em pacientes imunocompetentes, até infecções invasivas e disseminadas como as fungemias em pacientes imunocomprometidos. Objetivos: (1) Avaliar de forma descritiva as características fenotípicas de 157 cepas de Fusarium spp. isoladas de episódios de infecções em humanos e coletas ambientais; (2) Descrever a prevalência de diferentes espécies de Fusarium encontradas nestas amostras. (3) Definir o perfil de susceptibilidade dessas cepas utilizando o método de microdiluição em caldo descrito no documento M38-A2 publicado pelo Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI), frente aos antifúngicos Anfotericina B, Fluconazol, Itraconazol, 5-fluorocitosina e Voriconazol. Material e Métodos: Foram avaliadas 126 cepas clínicas e 31 cepas ambientais de Fusarium spp. que foram coletadas entre os anos de 1996 e 2008. Estas cepas estavam armazenadas no banco de microrganismos do Laboratório Especial de Micologia na Universidade Federal de São Paulo - UNIFESP. Os isolados foram identificados por análise das características macro- e micromorfológicas, seguindo a chave de identificação publicada por De Hoog et al, (2000). A avaliação da susceptibilidade in vitro dos isolados foi realizada pelo método de microdiluição em caldo, de acordo com as normas de padronização publicadas no documento M38-A2 do CSLI (2008). Foram realizadas leituras de 24, 48 e 72h de incubação. Resultados: Analisou-se um total de 157 amostras clínicas e ambientais, incluindo 143 cepas do complexo Fusarium solani (91,1%), 07 do complexo Fusarium dimerum (4,5%), 04 do complexo Fusarium incarnatum (2,5%), 02 de Fusarium verticillioides (1,3%) e 01 do complexo Fusarium oxysporum (0,6%). A maioria dos isolados (98 a 100%) apresentou baixa ou nula susceptibilidade a fluconazol, itraconazol e 5-fluorocitosina, independente dos períodos de incubação dos ensaios. Para anfotericina B e voriconazol, foi documentado aumento substancial no percentual de cepas inibidas em concentrações de droga superiores a 2,0µg/mL entre as leituras realizadas após 24 versus leituras realizadas após 48h/72h de incubação. Em relação aos ensaios de susceptibilidade aos antifúngicos observamos que para voriconazol leituras realizadas após 24h de incubação apresentam maior correlação com as taxas de sucesso terapêutico descritas em séries abertas tratadas com este medicamento. Conclusões: Verificamos que há predomínio de cepas do complexo Fusarium solani tanto nas amostras de micoses superficiais como nas amostras de micoses invasivas. Finalmente, tendo em vista os dados do perfil de susceptibilidade obtidos in vitro, anfotericina B apresenta maior atividade que voriconazol contra as cepas do complexo Fusarium solani e o oposto é observado entre as cepas de Fusarium não-solani avaliadas neste estudo.
- ItemAcesso aberto (Open Access)Ceratites por Fusarium spp no Brasil e Estados Unidos: avaliação por genotipagem, testes de sensibilidade a antifúngicos e resultados clínicos(Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 2013) Oechsler, Rafael Allan [UNIFESP]; Höfling-Lima, Ana Luisa [UNIFESP]; http://lattes.cnpq.br/2062861273062973; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)Os objetivos deste estudo sao: 1) Estudar e comparar a diversidade filogenetica de cepas de Fusarium spp isoladas de casos de ceratites infecciosas no Sul da Florida u Estados Unidos da America (EUA) por meio de identificacao por genotipagem e metodos microbiologicos de analise fenotipica; 2) Analisar as especies de Fusarium isoladas de ceratites no Sul da Florida u EUA identificadas por genotipagem, seus perfis de susceptibilidade in vitro a antifungicos, bem como os dados clinicos dos pacientes; 3) Estudar e comparar a diversidade filogenetica de cepas de Fusarium spp isoladas de casos de ceratites infecciosas no Brasil, identificadas por genotipagem e metodos microbiologicos de analise fenotipica, os resultados dos testes de susceptibilidade in vitro a antifungicos e os dados clinicos dos pacientes; 4) Comparacao dos dados de identificacao de cepas de Fusarium spp de portadores de ceratites infecciosas nos EUA e no Brasil, avaliando tambem a susceptibilidade a antifungicos e os dados clinicos dos pacientes estudados. Para a identificacao das cepas provenientes de casos de ceratite por Fusarium spp nos EUA e no Brasil, utilizou-se a analise de sequencia de DNA da regiao Internal Transcribed Spacer (ITS), assim como a classificacao morfologica pela microbiologia tradicional, com o estudo macro e microscopico das cepas. Testes por microdiluicao em caldo foram efetuados para obter-se os perfis de susceptibilidade in vitro das cepas estudadas aos antifungicos natamicina, anfotericina B e voriconazol. Os prontuarios dos respectivos pacientes foram analisados e suas caracteristicas clinicas comparadas aos dados de genotipagem e testes de susceptibilidade a antifungicos. Nos EUA 58 isolados de ceratites foram classificados por genotipagem em: Fusarium solani (75%), F. oxysporum (16%), F. incarnatum-equiseti (5%), F. dimerum (2%) e um Fusarium spp (2%) que nao foi classificado dentro de nenhum complexo de especies. Isolados de F. solani tiveram valores de MIC90 de voriconazol significativamente mais elevados do que os F. nao-solani (16 e 4ug/ml, respectivamente). Os pacientes com isolados de F. solani tambem exibiram um tempo para cura mais longo (65 vs 40 dias), uma pior acuidade visual final media (20/118 vs 20/36), e um maior necessidade de ceratoplastia terapeutica (7 vs 0 cirurgias), quando comparados aos que tiveram infeccoes causadas por F. nao-solani. O uso de lentes de contato foi o fator de risco mais frequente entre os pacientes deste estudo (66%). No Brasil os 41 isolados de ceratites foram classificados genotipicamente em: F. solani (88%), F. oxysporum (5%), F. dimerum (2%) e dois Fusarium spp (5%) que nao foram classificados dentro de nenhum complexo de especies. O atraso para o inicio do tratamento foi de 19 dias em media, e o tempo para a cura foi em media 107 dias. A acuidade visual final dos pacientes variou de 20/20 a percepcao de luz e foi em media 20/800 (LogMAR 1,6). A historia de trauma foi o fator de risco mais frequente, estando presente em 20 pacientes (50%). Ceratoplastia terapeutica foi necessaria em 22 pacientes (54%). A anfotericina B teve os menores valores de MIC90 (2ug/ml) tanto no Brasil como nos EUA. Voriconazol teve os maiores valores (16ug/ml) em ambos paises. Os isolados foram um pouco mais resistentes a natamicina no Brasil (8 vs 4 ug/ml nos EUA), e neste pais tambem houve uma associacao entre cepas com maior MIC para natamicina e maior necessidade de ceratoplastia terapeutica. Pela comparacao dos resultados de identificacao, susceptibilidade a antifungicos e dados clinicos, obtidos de casos de ceratites por Fusarium spp nos EUA e no Brasil, e possivel concluir-se que: as acuidades visuais inicial e final foram piores no Brasil; um maior numero de homens e trauma estavam presentes no estudo brasileiro ao inves de mulheres e uso de lentes de contato (LC) nos EUA; um maior numero de ceratoplastias terapeuticas foram necessarias no Brasil; e um maior tempo para o diagnostico e para a cura foram encontrados no Brasil
- ItemSomente MetadadadosDiversidade genotípica de cepas de Fusarium solani isoladas de episódios de ceratites(Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 2004) Godoy Martinez, Patricio Christian [UNIFESP]; Colombo, Arnaldo Lopes [UNIFESP]Propósito: As espécies do gênero Fusarium são agentes comuns de infecções oculares em humanos, sendo a ceratite sua principal manifestação clínica. A ceratite é comumente vista em habitantes das áreas tropicais e subtropicais. Sua incidência está correlacionada com o tempo das colheitas, sazonabilidade, temperatura e umidade. Os objetivos do estudo foram; 1º avaliar a taxa de prevalência de Fusarium entre os pacientes com ceratites; 2º adaptar o método de ERIC-PCR para genotipar as cepas de Fusarium; 3º avaliar a diversidade genética de F. solani utilizando 2 métodos diferentes. Métodos: Todos os casos de ceratites por fungos diagnosticados num período de 6 anos (1996 a 2002) no Laboratório de Microbiologia do Departamento de Oftalmologia da Universidade Federal de São Paulo foram revisados. 0 diagnóstico foi estabelecido por exame direto das escamas de córnea e cultura. Os fungos isolados foram identificados de acordo com métodos clássicos. Isolados de Fusarium solani foram genotipados utilizando 2 métodos: ERIC-PCR e PCR-RFLP. Resultados: Cento e cinqüenta e dois fungos isolados de ceratites foram diagnosticados durante o período estudado. As espécies mais isoladas foram: F. solani, seguido de Candida albicans, Paecilomyces lilacinus e Aspergillus flavus. Um total de 44 isolados de F. solani, incluindo 35 epidemiológicamente não relacionados e 9 isolados obtidos de 4 pacientes, foram tipados por ERIC-PCR e PCR-RFLP. O padrão de bandas obtido com ERIC-PCR incluiu 12 a 27 bandas de amplificação. Trinta e nove genótipos foram obtidos com os 44 isolados. O padrão de bandas obtidos com PCR-RFLP incluiu 1 a 8 bandas de amplificação. Treze genótipos foram obtidos com as 44 cepas. Conclusões: F. solani foi à espécie mais isolada causando ceratites micóticas. Os padrões de bandas gerados por ERIC-PCR tiveram um maior poder discriminatório que PCR-RFLP para diferenciar as cepas de F. solani. A tipagem molecular revelou grande heterogeneidade genética das cepas de F. solani estudadas.
- ItemAcesso aberto (Open Access)Effect of topical 0.5% povidone-iodine compared to 5% natamycin in fungal keratitis caused by Fusarium solani in a rabbit model: a pilot study(Conselho Brasileiro de Oftalmologia, 2008-12-01) Oliveira, Lauro Augusto De [UNIFESP]; Takata, Thales Takeo [UNIFESP]; Shiguematsu, Alvio Isao [UNIFESP]; Melo Júnior, Luiz Alberto Soares [UNIFESP]; Gompertz, Olga Fischman [UNIFESP]; Sousa, Luciene Barbosa De [UNIFESP]; Mannis, Mark J.; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP); University of CaliforniaPURPOSE: To evaluate the efficacy of topical administration of 0.5% povidone-iodine in experimental Fusarium solani keratitis in rabbits. METHODS: Fungal keratitis caused by Fusarium solani was induced in the right eye of 24 New Zealand rabbits. The rabbits were randomly divided into 3 different treatment groups: Group I (povidone-iodine) - treated with topical 0.5% povidone-iodine; Group II (natamycin) - treated with topical 5% natamycin; and Group III (control) - treated with topical saline solution. In all groups the rabbits were treated for three days and then sacrificed. The corneas were excised, macerated and immersed in 10 mL BHI. Culture samples were plated daily on Sabouraud's agar for 7 days, and the number of colony-forming units (CFU) was counted. The rabbits were clinically evaluated during the treatment period. RESULTS: The povidone-iodine and natamycin groups demonstrated better efficacy than the control group based on the number of rabbits with no colonies growing. However, there were no statistically significant differences between the three groups when the number of CFU was analyzed (p>0.05). CONCLUSIONS: Our study demonstrates important methodological considerations in the use of in vivo animal models for the testing of antifungal agents. Using this sample size and methodology of counting CFU, topical 0.5% povidone-iodine demonstrated no benefit in the treatment of experimental Fusarium solani when compared with topical 5% natamycin.
- ItemSomente MetadadadosEficacia do fluconazol subconjuntival na ceratite experimental por fusarium solani em modelo animal(Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 1998) Freda, Roberto [UNIFESP]
- ItemAcesso aberto (Open Access)Microscopia confocal in vivo no diagnóstico de ceratite fúngica: relato de caso(Conselho Brasileiro de Oftalmologia, 2006-06-01) Victor, Gustavo; Alves, Milton Ruiz; Nosé, Walton [UNIFESP]; Universidade de São Paulo (USP); Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP); Universidade Metropolitana de Santos Departamento de OftalmologiaThe authors describe a case of fungal keratitis that the in vivo confocal microscopy helped in the diagnosis and follow-up. Confocal microscopy was done in a patient's ulcer that did not improve with several topical medicines. Corneal scrapings were obtained and culture results were without conclusion. We observed hyphae and infectious collections on confocal microscopy. New corneal culture showed Fusarium sp ten days after confocal diagnosis.
- ItemAcesso aberto (Open Access)Ocorrência de fungos em sistema de distribuição de água e sua correlação com isolados do ar em uma unidade pediátrica de transplante de células tronco hematopoiéticas(Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), 2009-07-29) Rocha, Sabrina Mesquita [UNIFESP]; Colombo, Arnaldo Lopes [UNIFESP]; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)Introduction: The expansion of the immunocompromised patient population in the last two decades has led to an increased incidence of invasive fungal infections, especially by filamentous fungi. Although external sources of contamination are well known related to airconditioning in units of risk, recent investigations have shown that water distribution systems or linked to tanks of hospitals have been also identified as an important source of infection when it is colonized by pathogenic fungi. Objectives: Quantify and identify samples of fungi isolated from water and air of a unit of HSCT, and evaluate them by using molecular techniques looking for their genetic relationship among strains of A. fumigatus, A. flavus and F. solani. Material and Methods: The current study was performed in a unit of HSCT, collecting samples monthly over 12-month period. Air samples were recovered from outdoor air, bathrooms, and rooms in hospital unit, the air sample was collected with six-faced Andersen collector, with Petri dishes containing Sabouraud-dextrose agar. All water samples were collected in sterile polystyrene bottles and passed through sterile 0.45um filters using a filtration apparatus. Using sterile forceps, the filters were place directly on Sabouraud-dextrose agar plates. The phenotypic identification was made using keys for identification of Hoog (2000). In the genotypic analysis, the isolates of A. fumigatus, A. flavus and F. solani were typing using oligonucleotide and microsatellite minisatellite. Results: A total of 164 samples of water where collected. We observed higher amount of conidia in the months corresponding to the autumn and summer. The average conidia were 6.07 CFU / l. The most prevalent genera were Paecilomyces, Penicillium and Cladosporium. Fusarium was more frequent in the water of the unit. The unique parameter correlated to the increasing isolation of fungi was the water temperature. In the microbiological analysis of air from the hospital unit, a total of 264 samples were collected recovering larger quantities of conidia during the fall. The individual average of conidia was 11.09 CFU/m3. The most prevalent genera were Cladosporium and Penicillium. The genus Aspergillus was isolated in the air mostly indoor. In the molecular analysis, it was observed poor similarity among F. solani strains from air and water, however, we reported that two isolates remained in the hydraulic system of the unit for a period over 30 days. Two samples of air, showed 2 distinct environment strains of A. fumigatus showing high similarity through molecular analysis. In our molecular analysis, conflicting profiles of A. flavus strains were obtained with different oligonucleotide, it was not possible to establish any direct relationship between samples of air and water. Conclusions: environmental surveillance in the units of risk is the highest importance not only applying to outbreaks, as well as to evaluate potential sources of nosocomial infection. Pathogenic fungi to humans can be often isolated, and persist in the water for months in the hydraulic system as a reservoir of infection. We did not identified genetic relationship among samples from air and water, propagules of A. fumigatus, A. flavus and F. solani.