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Title: Caracterização molecular de micobactérias ambientais e avaliação de degradação de hidrocarbonetos
Authors: Niero, Cristina Viana Niero [UNIFESP]
Uzam, Camilla de Paula Pereira [UNIFESP]
Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Keywords: micobacterias nao tuberculosas
biorremediação
hidrocarbonetos
espectometris de massas
maldi-tof
Issue Date: 25-Sep-2013
Publisher: Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Citation: UZAM, Camilla de Paula Pereira. Caracterização molecular de micobactérias ambientais e avaliação de degradação de hidrocarbonetos. 2013. 80 f. Dissertação (Mestrado) - Instituto de Ciências Ambientais, Químicas e Farmacêuticas, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Diadema, 2013.
Abstract: The genus Mycobacterium has 165 species from which 157 belong to nontuberculous mycobacteria group (NTM). In spite of its medical interest, environmental mycobacteria started to gain attention due to their ability to degrade polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs). There is an urgent need for new techniques to rapidly identify mycobacteria isolated. This project approached two topics: the evaluation of mass spectrometry technique (MALDI-TOF) to rapid identify environmental mycobacteria and an examination of the potential of degradation of hydrocarbons by this group of microorganisms. We used a collection of mycobacteria reference strains and clinical isolates to generate the mass spectrometry sprectrum (MALDI-TOF) and we validated it against the Bruker Daltonics spectra database v3. One hundred twenty-five environmental isolates were identified using PRA-hsp65 and MALDI-TOF. The comparative analysis of results of PRA-hsp65 and mass spectrometry for identification of mycobacteria showed 100% agreement, but only eleven samples were identified at the level of species by the latter technique. The mass spectrometry method is promising but requires a representative database of spectra of reference samples, clinical and environmental, well characterized in order to provide reliability to the results obtained. Finally, it was possible to isolate, identify and characterize chemically one mycobacteria (MCVA038) which decomposes hydrocarbons of high molecular weight.
O gênero Mycobacterium possui 165 espécies das quais 157 pertencem ao grupo de micobactérias não tuberculosas (NTM). Além do interesse na área médica, as micobactérias ambientais começaram a despertar interesse pela capacidade de degradação de hidrocarbonetos aromáticos policíclicos (HPA). Há a necessidade de novas técnicas para identificar rapidamente isolados de micobactérias. Este projeto abordou dois tópicos: a avaliação da técnica de espectrometria de massa (MALDI-TOF) para identificação rápida de micobactérias ambientais e a avaliação do potencial de degradação de hidrocarbonetos por esse grupo de microrganismos. Nós usamos uma coleção de referência de micobactérias e isolados clínicos para gerar espectros de massa e validamos contra o banco de dados da Bruker Daltonics v3. Cento e vinte e cinco isolados ambientais foram identificados usando PRA-hsp65 e MALDI-TOF. A análise comparativa dos resultados de PRA-hsp65 e MALDI-TOF mostraram concordância de 100%, mas somente onze isolados foram identificados no nível de espécie pela última técnica. A espectrometria de massa é promissora, mas necessita de um banco de dados com espectros de amostras de referência, clínicas e ambientais bem caracterizadas para fornecer confiabilidade aos resultados obtidos. Finalmente, foi possível isolar, identificar e caracterizar quimicamente uma micobactéria (MCVA038) que degrada hidrocarbonetos de alto peso molecular.
URI: http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/48713
Other Identifiers: https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=89836
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