Prevalência dos genes qnr, aac (6’)Ib-cr e qepA entre isolados clínicos de enterobactérias

Prevalência dos genes qnr, aac (6’)Ib-cr e qepA entre isolados clínicos de enterobactérias

Título alternativo Prevalence of qnr, aac (6’)Ib-cr and qepA genes in clinical isolates of Enterobacteriaceae
Autor Barbosa, Paula Ignez Pilar Lemos Autor UNIFESP Google Scholar
Orientador Gales, Ana Cristina Autor UNIFESP Google Scholar
Instituição Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Resumo The aim of this study was evaluated the frequency of the plasmid mediated quinolone resistance genes qnr, aac(6’)Ib-cr and qepA. Were evaluated 231 Enterobacteriaceae isolated during the June of 2008 by the Central Laboratory of the São Paulo Hospital. Were analyzed by multiplex PCR followed by sequencing of the respective amplicons determinants qnrA, qnrB, qnrS, qnrC, qepA and aac(6’)Ib. Into all the 231 enterobacterial isolates analyzed, nine had 99% homology with qnr genes described in the literature, among them, one E. aerogenes showed identical sequence to the gene qnrS1, three K. pneumoniae isolates showed sequences identical to qnrS1 and qnrB2, one E. cloacae showed sequence identical with qnrS1 and three E. coli presents sequence identical with qnrB19 and qnrS1. The qepA genes were not found by the PCR methodology. The aac(6’)Ib gene was found in 14 samples and the sequence of the amplicons demonstrated that five samples showed the variant aac(6’)Ib-cr, among them, two E. coli, two K.pneumoniae and one E.cloacae. In analyzing the transfer of qnr determinants by conjugation technique, samples of E. aerogenes carrier determinant qnrS1, K. pneumoniae and E. coli carrier qnrS1 had transferred its determinants in the recipient cell. The transfer of genes contained in conjugative plasmids was confirmed by PCR technique. The analysis of genetic similarity among isolates positives for the qnr determinants by the methodology of PFGE profiles showed clonal and related determinants qnr different. However we can conclude that the frequency of the determinants qnr and aac(6’)ib-cr was low (3,46% and 2,16% respectively), the determinant qepA was not found; qnrS the determinant was more prevalent among the enterobacterial studied and was the first report of this gene in Brazilian samples and in E. aerogenes species. The determinant qnrB2 and qnrS1 was conjugated to recipient cells indicate that may be contained in conjugative plasmids, but more studies are needed to characterize the genetic context. The analysis of genetic similarity revealed that samples with the same genetic profile qnr genes are different, indicating that they were probably contained in mobile elements.

Este estudo foi desenhado com o objetivo de avaliar a frequência dos genes plasmideais que conferem resistência às quinolonas. Foram avaliadas 231 enterobactérias isoladas durante o mês de junho de 2008 pelo Laboratório Central do Hospital São Paulo. Foi avaliada pela técnica da PCR multiplex seguida do sequenciamento dos respectivos amplicons os determinantes qnrA, qnrB, qnrS, qnrC, qepA e aac(6’)Ib. De 231 enterobactérias avaliadas 9 possuíam o determinante qnr e o sequenciamento demonstrou homologia de 99% com genes descritos, entre elas, 1 E. aerogenes apresentou sequência idêntica ao gene qnrS1, 3 K. pneumoniae apresentaram sequências idênticas aos genes qnrS1 e qnrB2. A presença do determinante qepA não foi identificado pela metodologia PCR em nenhuma das amostras avaliadas. O determinante aac(6’)Ib foi verificado em 14 isolados e o sequenciamento dos amplicons revelou que 5 isolados apresentaram a variante aac(6’)Ib-cr, entre eles 2 E.coli, 2 K. pneumoniae e 1 E. cloacae. Na análise da transferência dos determinantes qnr pela técnica de conjugação, as amostras de E. aerogenes carreado do determinante qnrS1, K. pneumoniae carreada do determinante qnrB2 e E.coli carreada do determinante qnrS1, tiveram seus determinantes transferidos para a célula receptora. A transferência dos genes contidos em plasmídeos conjugativos foi confirmada pela técnica de PCR. A análise da similaridade genética entre os isolados positivos para o determinante qnr pela metodologia do PFGE demonstrou perfis clonais e relacionados com determinantes qnr diferentes. Contudo podemos concluir que a frequência dos determinantes qnr e aac(6’)Ib-cr foi baixa ( 3, 46% e 2,16% respectivamente); o determinante qepA não foi encontrado; o determinante qnrS foi o mais prevalente entre as enterobactérias estudadas constituindo o primeiro relato desse determinante no Brasil e na espécie E. aerogenes. Os determinantes qnrB2 e qnrS1 foram conjugados para células receptoras indicando que podem estar contidos em plasmídeos conjugativos porém mais estudos são necessários para caracterizar esse contexto genético. A análise da similaridade genética revelou que amostras com o mesmo perfil genético possuem determinantes qnr diferentes, indicando que provavelmente estavam contidos em elementos móveis.
Palavra-chave qnr
aac(6)’-ib-cr
qepA
Enterobactérias
Idioma Português
Data de publicação 2011-04-27
Publicado em BARBOSA, Paula Ignez Pilar Lemos. Prevalência dos genes qnr, aac (6’)Ib-cr e qepA entre isolados clínicos de enterobactérias. 2011. Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, 2011.
Publicador Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Extensão 96 p.
Direito de acesso Acesso restrito
Tipo Dissertação de mestrado
Endereço permanente http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/9965

Exibir registro completo




Arquivo

Nome: Retido-12497.pdf
Tamanho: 1.980MB
Formato: PDF
Descrição:
Abrir arquivo

Este item está nas seguintes coleções

Buscar


Navegar

Minha conta