Avaliação de um teste in house de PCR-colorimétrico em placa para o diagnóstico de Tuberculose Pulmonar

Avaliação de um teste in house de PCR-colorimétrico em placa para o diagnóstico de Tuberculose Pulmonar

Título alternativo Evaluation of microwell Colorimetric PCR in house for pulmonar tuberculosis diagnosis
Autor Rivero, Martha Gabriela Celle Autor UNIFESP Google Scholar
Orientador Pignatari, Antonio Carlos Campos Autor UNIFESP Google Scholar
Instituição Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Pós-graduação Infectologia – São Paulo
Resumo The techniques most widely used in the routine laboratory diagnosis of pulmonary tuberculosis (PTB) show variable sensitivities. Various nucleic acids amplification tests have been proposed for the rapid diagnosis of PTB in association with the acid-fast bacillus staining, culture and clinical diagnosis. We evaluated the performance of an in-house colorimetric PCR test using the IS6110 sequence in samples of sputum, broncho-alveolar lavage and tracheal aspirate from 150 patients with clinical suspicion of PTB admitted to a General University Hospital in the period from March to December 2005. The colorimetric PCR test was applied to non-processed samples (NPS) and to the sediment. The validity of the test was estimated in comparison with culture and clinical diagnosis of PTB. The sensitivity of the in house colorimetric PCR test was 41.93% (NPS) and 48.38% (sediment) and specificity 98.21% (NPS) and 97.67% (sediment). The in house colorimetric PCR test had a good agreement, kappa = 0.6, in comparison to the acid-fast staining and kappa = 0.5 when compared to culture. Considering the clinical diagnosis, sensitivity was 28.6% (NPS and sediment) and specificity 98.2% (NPS) and 97.3% (sediment). The positive and negative predictive values were 83.3% and 81.1% for NPS and 76.9% and 81.2% for sediment, respectively. The in house colorimetric PCR test showed low sensitivity, high specificity and good agreement compared with acid-fast bacillus staining and culture used for diagnosis of PTB in a routine microbiology laboratory at a General University Hospital The test also showed high predictive values (positive and negative) and high positive post-test probability when the clinical diagnosis was considered.

As técnicas mais utilizadas no diagnóstico laboratorial de rotina para tuberculose pulmonar (TBP) apresentam sensibilidade variável. Diversos testes de amplificação de ácidos nucléicos têm sido propostos para o diagnóstico rápido da tuberculose pulmonar em associação com a pesquisa de BAAR, cultura e o diagnóstico clínico. Neste estudo avaliamos o desempenho de um teste in house de PCR colorimétrico utilizando a seqüência IS6110 em amostras de escarro, lavado brônquio alveolar e aspirado traqueal de 150 pacientes internados com suspeita clínica de TBP em um Hospital Geral Universitário no período de março a dezembro de 2005. Foi realizada a PCR colorimétrica em amostras não processadas (ANP) e em sedimentos. A validade do teste foi estimada em comparação com a baciloscopia, cultura e diagnóstico clínico de TBP. A sensibilidade do teste in house PCR colorimétrico foi de 41,93% (ANP) e 48,38% (sedimento) e a especificidade de 98,21% (ANP) e 97,67% (sedimento) em comparação com a cultura. O teste in house PCR colorimétrico teve uma boa concordância, kappa = 0,6, em comparação com a baciloscopia e kappa = 0,5 quando comparado à cultura. Com respeito ao diagnóstico clínico a sensibilidade foi de 28,6% (ANP e sedimento) e a especificidade de 98,2% (ANP) e 97,3% (sedimento) Os valores preditivos positivo e negativo obtidos foram de 83,3% e 81,1% para ANP e de 76,9% e 81,2% para sedimento, respectivamente. O teste in house de PCR colorimétrico apresentou baixa sensibilidade, mas demonstrou ser altamente específico para o diagnóstico de TBP, além de apresentar boa concordância com os demais métodos utilizados na rotina laboratorial em um Hospital Geral Universitário para o diagnóstico de TBP. Em relação ao diagnóstico clínico observamos alto valor preditivo (positivo e negativo) e alta probabilidade positiva pós-teste.
Palavra-chave Mycobacterium tuberculosis
Reação em cadeia da polimerase
Tuberculose pulmonar
Idioma Português
Financiador Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
Data de publicação 2008-05-28
Publicado em RIVERO, Martha Gabriela Celle. Avaliação de um teste in house de PCR-colorimétrico em placa para o diagnóstico de Tuberculose Pulmonar. 2008. 139 f. Tese (Doutorado em Ciências) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo, 2008.
Publicador Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Extensão 139 f.
Direito de acesso Acesso aberto Open Access
Tipo Tese de doutorado
Endereço permanente http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/9073

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Nome: Publico-10760.pdf
Tamanho: 1.064MB
Formato: PDF
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