Caracterização genotípica e análise da diversidade genética em agentes da paracoccidioidomicose

Caracterização genotípica e análise da diversidade genética em agentes da paracoccidioidomicose

Author Roberto, Thiago Nunes Autor UNIFESP Google Scholar
Advisor Camargo, Zoilo Pires de Camargo Autor UNIFESP Google Scholar
Institution Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Graduate program Microbiologia e Imunologia
Abstract Paracoccidioidomycosis (PCM) is a systemic fungal infection caused by thermo-dimorphic fungi belonging to the genus Paracoccidioides and with high prevalence in Latin America. The etiologic agent of PCM is formed by a complex of different cryptic species which, in turn, is divided into two distinct species: P. brasiliensis (with three cryptic species ? S1, PS2 and PS3) and P. lutzii. However, morphological studies from different isolates revealed that between the different genetic groups there is no significant variation in cell size, in other words, this tool is not recommended to discriminate among the cryptic species. Therefore, we aimed to genotype and analyze the genetic diversity of different Paracoccidioides spp. isolates trough new molecular techniques. In this study, 165 clinical and environmental isolates from different geographic regions were genotyped by TUB1-RFLP. After standardization of in vitro experiment, we observed that among the total strains analyzed, 56% (92) had the restriction profile for S1 cryptic specie; 13% (22) had the profile for the PS2 specie; 9% (14) had the digestion profile of PS3 specie; and 22% (37) of the isolates were genotyped as belonging to the specie P. lutzii. Furthermore, the AFLP in vitro experiments showed significant genetic variability among these same isolates characterized by TUB1-RFLP, nevertheless, we observed a correlation between the different genetic groups, i.e., different clades were formed and the isolates were grouped according to their respective phylogenetic species (corroborating the genotyping results). Still, we found mainly that the S1 specie is the most dispersed among the Latin America countries; the cryptic specie PS3 is formed mostly by isolates from Colombia, however, there are isolates from Brazil, Venezuela and Uruguay; and the specie P. lutzii is found, mostly in the Midwest region of Brazil. Overall, our study presented two distinct molecular tools able to characterize the Paracoccidioides spp. isolates, which will serve as input for new research to understanding the disease.

A paracoccidioidomicose (PCM) é uma infecção fúngica sistêmica causada por fungos termo-dimórficos pertencentes ao gênero Paracoccidioides e com grande prevalência na América Latina. O agente etiológico da PCM é formado por um complexo de diferentes espécies crípticas que, por sua vez, dividem-se em duas espécies distintas: P. brasiliensis (com três espécies crípticas ? S1, PS2 e PS3) e P.lutzii. Contudo, estudos morfológicos de diferentes isolados revelaram que entre os diferentes grupos genéticos não há uma variação significativa no formato das células, ou seja, essa ferramenta não é suficiente para discriminar as espécies crípticas. Assim sendo, objetivamos genotipar e analisar a diversidade genética de diferentes isolados de Paracoccidioides spp. por meio de novas técnicas moleculares. Neste estudo, 165 isolados clínicos e ambientais oriundos de diferentes regiões geográficas foram genotipados por TUB1-RFLP. Após a padronização do experimento in vitro, observamos que dentre o total de cepas analisadas, 56% (92) obteve o perfil de restrição para a espécie críptica S1; 13% (22) obtiveram o perfil para a espécie PS2; 9% (14) apresentaram o perfil de digestão para a espécie PS3 e 22% (37) dos isolados foram genotipados como pertencentes à espécie P. lutzii. Além disso, os experimentos de AFLP in vitro revelaram variabilidade genética entre os mesmos isolados caracterizados por TUB1-RFLP, apesar disso, observamos uma correlação entre os diferentes grupos genéticos, isto é, diferentes clados foram formados e os isolados foram agrupados de acordo com as suas respectivas espécies filogenéticas (corroborando os resultados da genotipagem). Ainda, verificamos principalmente que a espécie S1 é a mais dispersa entre os países da América Latina; a espécie críptica PS3 é formada em sua maioria por isolados da Colômbia, contudo, há isolados provenintes do Brasil, Venezuela e Uruguai; e a espécie P. lutzii é econtrada, principalmente, na região centro-oeste do Brasil. Em geral, nosso estudo apresentou duas distintas ferramentas moleculares com capacidade de caracterizar os isolados de Paracoccidioides spp., que servirão de subsídios para novas pesquisas para o conhecimento da doença.
Keywords paracoccidioides
paracoccidioidomycosis
genotyping
genetic diversity
pcr-rflp
aflp
epidemiology
paracoccidioides
paracoccidioidomicose
genotipagem
diversidade genética
pcr-rflp
aflp
epidemiologia
Language Portuguese
Date 2015-06-30
Published in ROBERTO, Thiago Nunes. Caracterização genotípica e análise da diversidade genética em agentes da paracoccidioidomicose. 2015. 158 f. Dissertação (Mestrado) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, 2015.
Research area Microbiologia
Knowledge area Ciências biológicas
Publisher Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Extent 158 p.
Origin https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=2680704
Access rights Closed access
Type Dissertation
URI http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/47511

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