Mutações genéticas por microarrays e quantificação de dna humano nas fezes de pacientes com pólipo ou câncer colorretal

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dc.contributor.advisor Forones, Nora Manoukian Forones [UNIFESP] pt
dc.contributor.author Lima, Jacqueline Miranda de [UNIFESP]
dc.date.accessioned 2018-07-27T15:50:09Z
dc.date.available 2018-07-27T15:50:09Z
dc.date.issued 1905-07-05
dc.identifier https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=141831 pt
dc.identifier.citation LIMA, Jacqueline Miranda de. Mutações genéticas por microarrays e quantificação de dna humano nas fezes de pacientes com pólipo ou câncer colorretal. 2013. 71 f. Tese (Doutorado) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, 2013.
dc.identifier.uri http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/46393
dc.description.abstract Introdução: O câncer colorretal (CCR) representa a terceira causa de câncer no Brasil. O rastreamento tem por finalidade o diagnóstico precoce de câncer assim como de lesões pré-neoplásicas polipóides. Na carcinogênese colorretal ocorrem diversas alterações genéticas como mutação do gene APC, KRAS, BRAF, TP53 e PIKECA. Estas alterações podem também ser encontradas no DNA fecal após esfoliação de células tumorais. Objetivo: detectar mutações genéticas nas fezes de pacientes com CCR e pólipo e comparar com a presença dos mesmos ao tecido. Avaliar a capacidade diagnóstica de câncer ou pólipos colorretais pela quantidade de DNA humano nas fezes e métodos de microarray. Casuística e método: 154 pacientes com indicação de colonoscopia foram divididos em 3 grupos controle, câncer e pólipo. O DNA foi obtido de amostras de tecido e/ou fezes de todos os indivíduos. A quantificação de DNA humano foi realizada no DNA fecal. Foram utilizadas duas técnicas de microarray, RanplexCRC Array (28 mutações nos genes KRAS, BRAF, TP53 e APC) para DNA fecal e o KBP Array (20 mutações nos gene KRAS, BRAF e PIK3CA) para DNA tecidual e fecal. O sequenciamento foi realizado no DNA tecidual positivo para mutações pelo KBP. Resultados: A média de DNA humano foi de 15ng/ul nos pacientes com câncer e 0.46ng/ul no grupo controle (p=0,0001). Entre os pacientes com CCR, o método RanplexCRC detectou 61% de mutações, o KBP no tecido de 53,3% e nas fezes de 60,7%. No grupo controle, o percentual de genótipo selvagem no KBP tecidual e fecal foi de aproximadamente 95%. As mutações foram detectadas principalmente no códon 12 do gene KRAS. Observamos bom índice de correlação (64%) entre os dois métodos de detecção de mutação nas fezes nos pacientes com câncer e de 47% nos com pólipo. Conclusões: A quantificação de DNA humano nas fezes de pacientes com CCR pode ser um indicador de câncer colorretal. Excluídos os resultados inconclusivos, encontramos semelhança entre o percentual de pacientes com mutação tecidual e fecal pelo método KBP. O método KBP para tecido pode ser usado na detecção de mutações fecais em pacientes com câncer e pólipo. Palavras-chave: câncer colorretal, pólipo, APC, KRAS, BRAF, TP53, PIK3CA, microarray, DNA fecal en
dc.description.abstract Introdução: O câncer colorretal (CCR) representa a terceira causa de câncer no Brasil. O rastreamento tem por finalidade o diagnóstico precoce de câncer assim como de lesões pré-neoplásicas polipóides. Na carcinogênese colorretal ocorrem diversas alterações genéticas como mutação do gene APC, KRAS, BRAF, TP53 e PIKECA. Estas alterações podem também ser encontradas no DNA fecal após esfoliação de células tumorais. Objetivo: detectar mutações genéticas nas fezes de pacientes com CCR e pólipo e comparar com a presença dos mesmos ao tecido. Avaliar a capacidade diagnóstica de câncer ou pólipos colorretais pela quantidade de DNA humano nas fezes e métodos de microarray. Casuística e método: 154 pacientes com indicação de colonoscopia foram divididos em 3 grupos controle, câncer e pólipo. O DNA foi obtido de amostras de tecido e/ou fezes de todos os indivíduos. A quantificação de DNA humano foi realizada no DNA fecal. Foram utilizadas duas técnicas de microarray, RanplexCRC Array (28 mutações nos genes KRAS, BRAF, TP53 e APC) para DNA fecal e o KBP Array (20 mutações nos gene KRAS, BRAF e PIK3CA) para DNA tecidual e fecal. O sequenciamento foi realizado no DNA tecidual positivo para mutações pelo KBP. Resultados: A média de DNA humano foi de 15ng/ul nos pacientes com câncer e 0.46ng/ul no grupo controle (p=0,0001). Entre os pacientes com CCR, o método RanplexCRC detectou 61% de mutações, o KBP no tecido de 53,3% e nas fezes de 60,7%. No grupo controle, o percentual de genótipo selvagem no KBP tecidual e fecal foi de aproximadamente 95%. As mutações foram detectadas principalmente no códon 12 do gene KRAS. Observamos bom índice de correlação (64%) entre os dois métodos de detecção de mutação nas fezes nos pacientes com câncer e de 47% nos com pólipo. Conclusões: A quantificação de DNA humano nas fezes de pacientes com CCR pode ser um indicador de câncer colorretal. Excluídos os resultados inconclusivos, encontramos semelhança entre o percentual de pacientes com mutação tecidual e fecal pelo método KBP. O método KBP para tecido pode ser usado na detecção de mutações fecais em pacientes com câncer e pólipo. Palavras-chave: câncer colorretal, pólipo, APC, KRAS, BRAF, TP53, PIK3CA, microarray, DNA fecal pt
dc.format.extent 71 p.
dc.language.iso por
dc.publisher Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
dc.rights Acesso restrito
dc.subject câncer colorretal en
dc.subject pólipo en
dc.subject apc en
dc.subject kras en
dc.subject braf en
dc.subject tp53 en
dc.subject pik3ca en
dc.subject microarray en
dc.subject dna fecal en
dc.subject câncer colorretal pt
dc.subject pólipo pt
dc.subject apc pt
dc.subject kras pt
dc.subject braf pt
dc.subject tp53 pt
dc.subject pik3ca pt
dc.subject microarray pt
dc.subject dna fecal pt
dc.title Mutações genéticas por microarrays e quantificação de dna humano nas fezes de pacientes com pólipo ou câncer colorretal pt
dc.type Tese de doutorado
dc.contributor.institution Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) pt
dc.identifier.file 2013-0331.pdf
dc.description.source Dados abertos - Sucupira - Teses e dissertações (2013 a 2016)
unifesp.campus São Paulo, Escola Paulista de Medicina (EPM) pt
unifesp.graduateProgram Gastroenterologia pt
unifesp.knowledgeArea Ciências da saúde pt
unifesp.researchArea Medicina pt



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