Genetic analysis of Escherichia coli strains carrying enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) markers, isolated from children in Rio de Janeiro city, Brazil

Show simple item record

dc.contributor.author Regua-Mangia, Adriana Hamond
dc.contributor.author Gomes, Tania Aparecida Tardelli [UNIFESP]
dc.contributor.author Andrade, João Ramos da Costa
dc.contributor.author Vieira, Mônica Aparecida Midolli [UNIFESP]
dc.contributor.author Gonzalez, Alice Gonçalves Martins
dc.contributor.author Zahner, Viviane
dc.contributor.author Irino, Kinue
dc.contributor.author Teixeira, Lúcia Martins
dc.date.accessioned 2015-06-14T13:30:10Z
dc.date.available 2015-06-14T13:30:10Z
dc.date.issued 2003-11-01
dc.identifier http://dx.doi.org/10.1590/S1517-83822003000500013
dc.identifier.citation Brazilian Journal of Microbiology. Sociedade Brasileira de Microbiologia, v. 34, p. 38-41, 2003.
dc.identifier.issn 1517-8382
dc.identifier.uri http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/1896
dc.description.abstract In the present study, 47 enteropathogenic Escherichia coli strains identified according to serotyping, presence of eae, bfp and EAF sequences, adherence phenotype and ability to induce attaching-effacing lesions were analyzed by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), multilocus enzyme electrophoresis (MLEE), and the presence of LEE genes (eae, espA, espB, tir) as well as the respective alleles. Amplification of LEE genes subtypes revealed 18 different pathotypes. Typing of the eae gene showed that most strains contained nontypable intimin (42%) followed by beta (35%), gamma and alpha genes (12% each). PFGE analysis revealed a variable degree of polymorphism among isolates and, in general, no clear correlation was observed among PFGE profiles and the virulence markers identified. Otherwise, grouping based on MLEE analysis showed a close association between eae allele and clonal cluster distribution leading us to indicate the eae profile as a promising marker to establish relatedness among such microorganisms. en
dc.description.abstract No presente estudo, 47 amostras enteropatogênicas de Escherichia coli, previamente caracterizadas pelo sorotipo, fenótipo de aderência, habilidade de induzir a formação da lesão histopatológica e presença das seqüências genéticas eae, bfp e EAF, foram analisadas de acordo com o perfil de fragmentação do DNA cromossômico pela técnica de eletroforese em campo pulsado (PFGE), as variantes isoenzimáticas através da eletroforese de isoenzimas (MLEE) e a presença de seqüências específicas da região LEE (eae, espA, espB, tir) e respectivos alelos. A amplificação destas seqüências mostrou a presença de 18 padrões genéticos distintos. A tipagem do gene eae revelou que a maior parte das amostras apresentou intimina não-tipável (42%) seguida dos tipos alélicos beta (35%), gama e alfa (12% cada). A fragmentação do DNA cromossômico detectou um elevado polimorfismo genético entre as amostras estudadas e não foi observada uma correlação com os marcadores de virulência investigados. Por outro lado, a análise das variantes isoenzimáticas sugeriu uma distribuição clonal específica de variantes genéticas do locus eae, o que nos leva a indicar a sua utilização como um marcador promissor para definir as relações genéticas neste grupo de microrganismos. pt
dc.description.sponsorship Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ)
dc.format.extent 38-41
dc.language.iso eng
dc.publisher Sociedade Brasileira de Microbiologia
dc.relation.ispartof Brazilian Journal of Microbiology
dc.rights Acesso aberto
dc.subject enteropathogenic Escherichia coli en
dc.subject genetic diversity en
dc.subject virulence markers en
dc.subject Escherichia coli enteropatogênica pt
dc.subject diversidade genética pt
dc.subject marcadores de virulência pt
dc.title Genetic analysis of Escherichia coli strains carrying enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) markers, isolated from children in Rio de Janeiro city, Brazil en
dc.title.alternative Análise genética de amostras de Escherichia coli carreadoras de marcadores da Escherichia coli Enteropatogênica (EPEC), isoladas de crianças na cidade do Rio de Janeiro, Brasil pt
dc.type Artigo
dc.contributor.institution Fundação Oswaldo Cruz
dc.contributor.institution Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
dc.contributor.institution Universidade Estadual do Rio de Janeiro
dc.contributor.institution Universidade Federal Fluminense
dc.contributor.institution Instituto Adolfo Lutz
dc.contributor.institution Universidade Federal do Rio de Janeiro
dc.description.affiliation Fundação Oswaldo Cruz
dc.description.affiliation Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
dc.description.affiliation Universidade Estadual do Rio de Janeiro
dc.description.affiliation Universidade Federal Fluminense
dc.description.affiliation Instituto Adolfo Lutz
dc.description.affiliation Universidade Federal do Rio de Janeiro
dc.description.affiliationUnifesp UNIFESP
dc.identifier.file S1517-83822003000500013.pdf
dc.identifier.scielo S1517-83822003000500013
dc.identifier.doi 10.1590/S1517-83822003000500013
dc.description.source SciELO
dc.identifier.wos WOS:000207065500013



File

Name: S1517-83822003000500013.pdf
Size: 289.3Kb
Format: PDF
Description:
Open file

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Search


Browse

Statistics

My Account