Genetic analysis of Escherichia coli strains carrying enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) markers, isolated from children in Rio de Janeiro city, Brazil

Genetic analysis of Escherichia coli strains carrying enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) markers, isolated from children in Rio de Janeiro city, Brazil

Título alternativo Análise genética de amostras de Escherichia coli carreadoras de marcadores da Escherichia coli Enteropatogênica (EPEC), isoladas de crianças na cidade do Rio de Janeiro, Brasil
Autor Regua-Mangia, Adriana Hamond Google Scholar
Gomes, Tania Aparecida Tardelli Autor UNIFESP Google Scholar
Andrade, João Ramos da Costa Google Scholar
Vieira, Mônica Aparecida Midolli Autor UNIFESP Google Scholar
Gonzalez, Alice Gonçalves Martins Google Scholar
Zahner, Viviane Google Scholar
Irino, Kinue Google Scholar
Teixeira, Lúcia Martins Google Scholar
Instituição Fundação Oswaldo Cruz
Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Universidade Estadual do Rio de Janeiro
Universidade Federal Fluminense
Instituto Adolfo Lutz
Universidade Federal do Rio de Janeiro
Resumo In the present study, 47 enteropathogenic Escherichia coli strains identified according to serotyping, presence of eae, bfp and EAF sequences, adherence phenotype and ability to induce attaching-effacing lesions were analyzed by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), multilocus enzyme electrophoresis (MLEE), and the presence of LEE genes (eae, espA, espB, tir) as well as the respective alleles. Amplification of LEE genes subtypes revealed 18 different pathotypes. Typing of the eae gene showed that most strains contained nontypable intimin (42%) followed by beta (35%), gamma and alpha genes (12% each). PFGE analysis revealed a variable degree of polymorphism among isolates and, in general, no clear correlation was observed among PFGE profiles and the virulence markers identified. Otherwise, grouping based on MLEE analysis showed a close association between eae allele and clonal cluster distribution leading us to indicate the eae profile as a promising marker to establish relatedness among such microorganisms.

No presente estudo, 47 amostras enteropatogênicas de Escherichia coli, previamente caracterizadas pelo sorotipo, fenótipo de aderência, habilidade de induzir a formação da lesão histopatológica e presença das seqüências genéticas eae, bfp e EAF, foram analisadas de acordo com o perfil de fragmentação do DNA cromossômico pela técnica de eletroforese em campo pulsado (PFGE), as variantes isoenzimáticas através da eletroforese de isoenzimas (MLEE) e a presença de seqüências específicas da região LEE (eae, espA, espB, tir) e respectivos alelos. A amplificação destas seqüências mostrou a presença de 18 padrões genéticos distintos. A tipagem do gene eae revelou que a maior parte das amostras apresentou intimina não-tipável (42%) seguida dos tipos alélicos beta (35%), gama e alfa (12% cada). A fragmentação do DNA cromossômico detectou um elevado polimorfismo genético entre as amostras estudadas e não foi observada uma correlação com os marcadores de virulência investigados. Por outro lado, a análise das variantes isoenzimáticas sugeriu uma distribuição clonal específica de variantes genéticas do locus eae, o que nos leva a indicar a sua utilização como um marcador promissor para definir as relações genéticas neste grupo de microrganismos.
Palavra-chave enteropathogenic Escherichia coli
genetic diversity
virulence markers
Escherichia coli enteropatogênica
diversidade genética
marcadores de virulência
Idioma Inglês
Financiador Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ)
Data de publicação 2003-11-01
Publicado em Brazilian Journal of Microbiology. Sociedade Brasileira de Microbiologia, v. 34, p. 38-41, 2003.
ISSN 1517-8382 (Sherpa/Romeo, fator de impacto)
Publicador Sociedade Brasileira de Microbiologia
Extensão 38-41
Fonte http://dx.doi.org/10.1590/S1517-83822003000500013
Direito de acesso Acesso aberto Open Access
Tipo Artigo
Web of Science WOS:000207065500013
SciELO S1517-83822003000500013 (estatísticas na SciELO)
Endereço permanente http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/1896

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Nome: S1517-83822003000500013.pdf
Tamanho: 289.3KB
Formato: PDF
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